37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0093 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0093    100 
 
 		 379 bp  751    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0919107  normal  0.956622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  81.42 
 
 		 1464 bp  178  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  84.43 
 
 		 1464 bp  91.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  82.54 
 
 		 1467 bp  75.8  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  81.75 
 
 		 1467 bp  67.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  83.52 
 
 		 1467 bp  61.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  81.3 
 
 		 1470 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  81.3 
 
 		 1518 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  81.36 
 
 		 1470 bp  60  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  94.59 
 
 		 1467 bp  58  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  91.11 
 
 		 1422 bp  58  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  90.91 
 
 		 1476 bp  56  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  84.51 
 
 		 1464 bp  54  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  80.67 
 
 		 1464 bp  54  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  90.7 
 
 		 1467 bp  54  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  94.12 
 
 		 1476 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  94.12 
 
 		 1455 bp  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  94.12 
 
 		 1431 bp  52  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  94.12 
 
 		 1458 bp  52  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  80.16 
 
 		 1479 bp  52  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  91.89 
 
 		 1464 bp  50.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  81.19 
 
 		 1479 bp  50.1  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  91.89 
 
 		 1455 bp  50.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01640  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding protein  100 
 
 		 933 bp  50.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00689976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1687  glutamate synthase subunit beta  91.89 
 
 		 1458 bp  50.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000871139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  81.19 
 
 		 1479 bp  50.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  80.56 
 
 		 1464 bp  48.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  93.75 
 
 		 1458 bp  48.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  88.64 
 
 		 1488 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  88.37 
 
 		 1467 bp  46.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  88.37 
 
 		 1479 bp  46.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  88.37 
 
 		 1470 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3391  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  88.37 
 
 		 1506 bp  46.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498468  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  88.37 
 
 		 1470 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  88.37 
 
 		 1506 bp  46.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  88.37 
 
 		 1479 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  88.37 
 
 		 1467 bp  46.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>