More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0030 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0030  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  100 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0001068  hitchhiker  0.00000138683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0034  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  76.27 
 
 
298 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3464  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  50.86 
 
 
300 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0405  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.67 
 
 
304 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1640  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.25 
 
 
354 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0924245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0413  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.67 
 
 
312 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0629  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.67 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3431  hypothetical protein  48.96 
 
 
299 aa  231  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36467  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3149  hypothetical protein  48.64 
 
 
295 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0390  hypothetical protein  46.77 
 
 
279 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3390  methyltransferase  49 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0122  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.43 
 
 
291 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1061  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.74 
 
 
313 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3136  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  49.14 
 
 
300 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0631  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.13 
 
 
309 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.830849  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0201  hypothetical protein  47.06 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  47.39 
 
 
295 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0815274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3266  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3872  hypothetical protein  48.29 
 
 
299 aa  225  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3266  hypothetical protein  48.71 
 
 
300 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0215  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.67 
 
 
296 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0042  hypothetical protein  48.41 
 
 
295 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3820  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
295 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2802  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.460995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0025  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.306155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0404  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.25 
 
 
293 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1741  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3175  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
295 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3901  tetrapyrrole methylase family protein  48.41 
 
 
295 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2817  hypothetical protein  48.75 
 
 
276 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0289  hypothetical protein  48.75 
 
 
276 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4819  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  46.69 
 
 
318 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3767  hypothetical protein  43.31 
 
 
304 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84999  normal  0.0491283 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0196  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  50.86 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000023341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0270  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  46.86 
 
 
286 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4314  hypothetical protein  46.64 
 
 
292 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2281  hypothetical protein  46.75 
 
 
281 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.610951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1693  hypothetical protein  39.79 
 
 
291 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004500  tetrapyrrole (Corrin-Porphyrin) methylase family protein  41.39 
 
 
287 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.104686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2653  putative tetrapyrrole methyltransferase  40.94 
 
 
287 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0228  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.45 
 
 
280 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.330626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0108  hypothetical protein  43.06 
 
 
397 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0368422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4683  hypothetical protein  42.65 
 
 
293 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00892  corrin/porphyrin methyltransferase  42.8 
 
 
287 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2199  hypothetical protein  43.46 
 
 
286 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0114  hypothetical protein  41.43 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0912  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.24 
 
 
299 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538896  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4431  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3683  hypothetical protein  40.65 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0262  hypothetical protein  40.65 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0390  hypothetical protein  41.52 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.83739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0253  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.75 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.239733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0186  hypothetical protein  37.41 
 
 
291 aa  195  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3626  tetrapyrrole methylase family protein  39.21 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0301  methyltransferase  40.29 
 
 
281 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4112  hypothetical protein  39.22 
 
 
304 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796343  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0309  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.44 
 
 
295 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3353  hypothetical protein  40.29 
 
 
281 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13150  tetrapyrrole methylase family protein  40.36 
 
 
287 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0357  hypothetical protein  39.15 
 
 
281 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4250  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (corrin/porphyrin) methyltransferase  41.43 
 
 
280 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.150216  hitchhiker  0.00000000249407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0677  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.07 
 
 
326 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3692  hypothetical protein  40.07 
 
 
281 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0353  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.43 
 
 
280 aa  192  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3879  hypothetical protein  40.29 
 
 
281 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.071503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4186  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.21 
 
 
280 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4330  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.01 
 
 
305 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4593  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  41.22 
 
 
305 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0315173 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3691  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  43.78 
 
 
280 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3988  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  44.21 
 
 
280 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4068  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.21 
 
 
280 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0476  putative tetrapyrrole methylase  42.19 
 
 
299 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3450  hypothetical protein  42.37 
 
 
287 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3618  hypothetical protein  42.37 
 
 
287 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3558  hypothetical protein  42.37 
 
 
287 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1119  putative tetrapyrrole methylase  42.19 
 
 
299 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0540  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.19 
 
 
299 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0758  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  43.35 
 
 
287 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0741  methyltransferase  39.07 
 
 
281 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03013  predicted methyltransferase  42.37 
 
 
286 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0559  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  42.37 
 
 
286 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0352  tetrapyrrole methylase family protein  42.11 
 
 
306 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1178  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  42.24 
 
 
286 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.041672 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4465  tetrapyrrole methylase family protein  42.37 
 
 
286 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3441  tetrapyrrole methylase family protein  42.37 
 
 
287 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0274  hypothetical protein  41.03 
 
 
280 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000430645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02964  hypothetical protein  42.37 
 
 
286 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3521  hypothetical protein  42.37 
 
 
287 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3338  tetrapyrrole methylase family protein  42.37 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.725254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03354  putative methyltransferase  40.71 
 
 
292 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0552  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  41.95 
 
 
286 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.202744  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57470  hypothetical protein  43.91 
 
 
282 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4098  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  44.21 
 
 
280 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4418  tetrapyrrole methylase family protein  39.57 
 
 
289 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00450007  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1676  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  45.37 
 
 
273 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4994  hypothetical protein  43.86 
 
 
320 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.430559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1987  hypothetical protein  37.32 
 
 
285 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4011  hypothetical protein  41.73 
 
 
303 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.301912  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1750  hypothetical protein  44.93 
 
 
273 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0060  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  37.01 
 
 
273 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000025326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>