50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4976 on replicon NC_008762
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  100 
 
 		 206 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  30.99 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.85 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.5 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.8 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  31.41 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  35.57 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.41 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  35.35 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  29.27 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  39.08 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  37.93 
 
 		 144 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  27.12 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  29.5 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.21 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.68 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  27.86 
 
 		 280 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  37.35 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  27.89 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.34 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  36.45 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  27.78 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  27.86 
 
 		 289 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  27.86 
 
 		 289 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  25.91 
 
 		 247 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  25.35 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  25.85 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.11 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  28.67 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  25.45 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  25.19 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.83 
 
 		 273 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  24.26 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  24.75 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  27.48 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  27.48 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.41 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  27.41 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  28.95 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  28.57 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  29.91 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  27.08 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  29.89 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  24.51 
 
 		 216 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  26.83 
 
 		 233 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  24.15 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>