79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4814 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  34.75 
 
 		 523 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  35.24 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  32.91 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  33.12 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  33.12 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  31.78 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  32.48 
 
 		 345 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  32.8 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  33.65 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  31.97 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  35.33 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  33.65 
 
 		 344 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  32.8 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  32.8 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  33.54 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  37.27 
 
 		 530 aa  150  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.66 
 
 		 432 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  30.37 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  33.23 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  32.52 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  33.75 
 
 		 595 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  31.19 
 
 		 337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  31.19 
 
 		 337 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  32.82 
 
 		 566 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  31.45 
 
 		 721 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  31.07 
 
 		 424 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  29.97 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  32.32 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  31.39 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  30.75 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  31.39 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  30.45 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  36.04 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  37.67 
 
 		 357 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  30.66 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.35 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  36.04 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  37.74 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  27.03 
 
 		 831 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  28.69 
 
 		 777 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  28.32 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  30.33 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  29.25 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  31.51 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  29.49 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  26.61 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  28.63 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  28.17 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  27.82 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  28.26 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  28.75 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  28.81 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  26.51 
 
 		 539 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  27.44 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  28.51 
 
 		 1892 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  30.3 
 
 		 698 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  24.25 
 
 		 686 aa  53.5  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  32.2 
 
 		 726 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  30.49 
 
 		 1118 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  26.06 
 
 		 733 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  26 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  23.1 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  23.1 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  23.1 
 
 		 577 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  31.61 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  22.46 
 
 		 522 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  23.14 
 
 		 815 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  25.98 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  25.63 
 
 		 800 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  26.27 
 
 		 675 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  26.77 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  27.64 
 
 		 802 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  23.01 
 
 		 740 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  28.85 
 
 		 791 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  29.88 
 
 		 969 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>