More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4733 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  88.57 
 
 
210 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  48.54 
 
 
209 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  47.34 
 
 
209 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  44.44 
 
 
210 aa  178  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  44.98 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 
219 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  44.44 
 
 
215 aa  167  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  39.32 
 
 
202 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  37.37 
 
 
186 aa  144  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  36.89 
 
 
203 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  36.84 
 
 
203 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  33.65 
 
 
208 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  33.65 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
208 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.23 
 
 
203 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.62 
 
 
206 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.27 
 
 
205 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  33.49 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.69 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  118  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  31.58 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.92 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  31.63 
 
 
220 aa  111  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.76 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  31.1 
 
 
204 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  30.7 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  33 
 
 
204 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  29.35 
 
 
209 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  31.28 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  33.01 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  30.29 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  29.33 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.23 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.38 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 
205 aa  89  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 
203 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  30.19 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  26.94 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.84 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.11 
 
 
234 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  46.24 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  27.23 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  47.31 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.55 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.31 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  31.6 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  46.24 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  43.62 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  44.09 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  41.94 
 
 
212 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  43.01 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  25.12 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  38.95 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  30.26 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  40.86 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  41.24 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  41.24 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  28.71 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  39.78 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  41.49 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  31.19 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  38.71 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  44.58 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  27.75 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0748  putative glutathione S-transferase  32.77 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.206898  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  24.64 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  27.94 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  27.43 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  26.57 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5156  Glutathione S-transferase domain  29.69 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561496  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  40.96 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.52 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  38.71 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  40.96 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  29.25 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  40.96 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  39.78 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  40.96 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  40.96 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  27.05 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  30.43 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  27.05 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6162  Glutathione S-transferase domain  28.36 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  25.82 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>