More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4603 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4603  ATPase  100 
 
 
624 aa  1271    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.705883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2695  ATPase AAA-2 domain protein  41.96 
 
 
608 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5698  ATPase  35.47 
 
 
607 aa  300  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7071  ATPase  36.27 
 
 
607 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1418  ATPase AAA-2  36.2 
 
 
607 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6411  ATPase  36.2 
 
 
607 aa  298  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14960  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  34.01 
 
 
632 aa  294  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1111  ATPase AAA-2 domain protein  37.64 
 
 
639 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28920  putative chaperone  35.06 
 
 
627 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325759  hitchhiker  0.00000775064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2530  putative chaperone  35.28 
 
 
609 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3151  ATPase AAA-2  36.92 
 
 
634 aa  279  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000310841  unclonable  0.0000497822 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03530  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  42.55 
 
 
674 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.851007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  45.79 
 
 
859 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0447  ATPase  44.12 
 
 
867 aa  231  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.000000333741  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0194  ATP-dependent chaperone protein ClpB  44.75 
 
 
862 aa  230  5e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.68228  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  45 
 
 
861 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  43.25 
 
 
880 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  45.48 
 
 
870 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  42.81 
 
 
875 aa  228  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0453  ATP-dependent chaperone ClpB  43.46 
 
 
867 aa  228  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000117348  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  42.37 
 
 
854 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  44.41 
 
 
874 aa  226  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  41.85 
 
 
898 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  41.03 
 
 
875 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.15 
 
 
874 aa  225  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0583  ATP-dependent chaperone ClpB  44.22 
 
 
862 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1919  ATPase AAA-2  43.46 
 
 
870 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.494579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  44.67 
 
 
861 aa  225  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  43.92 
 
 
854 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1249  ATPase  43.79 
 
 
869 aa  225  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.748877  decreased coverage  0.00497256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  42.81 
 
 
857 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  42.07 
 
 
823 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  43.29 
 
 
862 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  42.81 
 
 
857 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  42.81 
 
 
857 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2499  ATPase  45.24 
 
 
868 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  44.3 
 
 
860 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  42.81 
 
 
857 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  42.81 
 
 
857 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000279848  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  43.85 
 
 
867 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  44.07 
 
 
861 aa  224  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  44.01 
 
 
812 aa  224  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02446  hypothetical protein  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000202693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000860565  decreased coverage  0.000000635783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168048  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  44.08 
 
 
874 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  42.67 
 
 
822 aa  223  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  39.33 
 
 
857 aa  223  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000839096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5181  ATP-dependent chaperone ClpB  43.58 
 
 
854 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  43.54 
 
 
864 aa  223  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  40.06 
 
 
814 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  45.39 
 
 
878 aa  223  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3212  protein disaggregation chaperone  42.72 
 
 
857 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  42.43 
 
 
862 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  42.24 
 
 
870 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0075  ATPase  42.24 
 
 
870 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0715422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  42.72 
 
 
857 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000133942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3128  ATPase  46.49 
 
 
859 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2201  ATPase AAA-2  44.22 
 
 
866 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.755667  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3813  ATP-dependent chaperone ClpB  42.9 
 
 
866 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162309  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  42.57 
 
 
865 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  48.78 
 
 
860 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2815  ATPase  42.24 
 
 
870 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565756  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  42.72 
 
 
857 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  41.91 
 
 
857 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  42.57 
 
 
865 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3497  ATPase  41.61 
 
 
857 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.648443  normal  0.0100947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  40.12 
 
 
857 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3072  protein disaggregation chaperone  42.81 
 
 
857 aa  222  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000111727  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  44.3 
 
 
862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  42.32 
 
 
867 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  44.15 
 
 
891 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  43.42 
 
 
814 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  45.07 
 
 
878 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1024  ATPase  41.82 
 
 
857 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  43.14 
 
 
864 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  44.82 
 
 
931 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  42.86 
 
 
818 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  44.82 
 
 
859 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  41.49 
 
 
857 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  41.49 
 
 
857 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  42.28 
 
 
857 aa  221  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000176912  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  41.49 
 
 
857 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  41.91 
 
 
857 aa  221  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  42.95 
 
 
859 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  42.76 
 
 
818 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  42.59 
 
 
866 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  44.78 
 
 
868 aa  221  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6458  ATP-dependent chaperone ClpB  42.99 
 
 
864 aa  220  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  41.45 
 
 
857 aa  220  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2032  ATP-dependent chaperone ClpB  42.95 
 
 
862 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  44.74 
 
 
865 aa  220  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  44.7 
 
 
874 aa  220  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  44.63 
 
 
870 aa  220  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  43.14 
 
 
865 aa  220  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>