265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4471 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  100 
 
 		 334 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  39.05 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  39.55 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  38.24 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  38.24 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  37.25 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  24.32 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  26.82 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  26.82 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  22.68 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  23.05 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  25.4 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  25.4 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  25.66 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  25.4 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  25 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  21.27 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  25.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  25.6 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  20.52 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  20.52 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  20.07 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  20.9 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  20.9 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  20.9 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  21.07 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  21.07 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  20.33 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  31.65 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  27.87 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  29.05 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  33.11 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  30.19 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  26.12 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  27.78 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  28.99 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  26.34 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  27.6 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  29.57 
 
 		 305 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  25.75 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  27.85 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  26.47 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  28.32 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  25.91 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  27.52 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  26.51 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  27.7 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  29.19 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  28.17 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  28.22 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  25.6 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  27.92 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  28.91 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  30.36 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  27.11 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0096  ParB family chromosome partitioning protein  29.65 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  25.43 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0108  ParB family chromosome partitioning protein  29.65 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0136  ParB family chromosome partitioning protein  29.65 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  29.88 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  29.88 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  29.88 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  27.19 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  26.15 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  27.18 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  29.02 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  28.37 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  28.49 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  29.88 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  24.88 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  29.46 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  24.21 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  27.98 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  27.7 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  25.25 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  25.22 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  26.05 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  27.98 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  24.18 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  24.18 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  29.25 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  26.52 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  25 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  27.32 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  27.75 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  22.89 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  29.05 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  29.05 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  28.83 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>