26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4350 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  100 
 
 
291 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  49.17 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  45.3 
 
 
247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  45 
 
 
269 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  47.17 
 
 
217 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  47.71 
 
 
383 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  45.13 
 
 
267 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  44.12 
 
 
182 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  50.67 
 
 
226 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  32.31 
 
 
230 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  44.83 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  44.83 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  45.05 
 
 
205 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  33.65 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  40.91 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  41.86 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  39.53 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  41.38 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  34.44 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  34.44 
 
 
250 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  34.09 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  34.09 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  32.46 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  38.27 
 
 
136 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  34.09 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  34.09 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>