34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4266 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  47.79 
 
 
239 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  43.61 
 
 
243 aa  185  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  42.92 
 
 
234 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  41.89 
 
 
247 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  38.29 
 
 
246 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  38.91 
 
 
255 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  25.36 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  25.57 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  25.84 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  27.97 
 
 
317 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  27.97 
 
 
317 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3786  chemotaxis protein MotB-related protein  23.65 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  22.49 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  28.88 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  26.27 
 
 
317 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  26.79 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6041  flagellar motor protein  27.5 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003240  chemotaxis protein MotB-related protein  22.69 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  32.52 
 
 
363 aa  45.4  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1361  hypothetical protein  22.65 
 
 
244 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  30.06 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6427  hypothetical protein  29.48 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.188529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  21.78 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  21.78 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  21.78 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  32.77 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  28.26 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  28.85 
 
 
366 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0872  OmpA/MotB  23.74 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178766  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 
385 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  28.92 
 
 
1987 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 
355 aa  41.6  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>