More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4108 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
330 aa  660  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  83.59 
 
 
335 aa  544  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  74.22 
 
 
333 aa  466  1e-130  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  67.27 
 
 
330 aa  438  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  70.59 
 
 
332 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  69.66 
 
 
333 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  75.79 
 
 
340 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  68.92 
 
 
339 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  67.18 
 
 
333 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  64.26 
 
 
333 aa  415  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  67.18 
 
 
333 aa  416  1e-115  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  60.92 
 
 
333 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  60 
 
 
327 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  59.38 
 
 
327 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  61.85 
 
 
327 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  62.77 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  62.77 
 
 
327 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  62.77 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  62.77 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  62.77 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  62.77 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  62.77 
 
 
327 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  61.54 
 
 
327 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  61.23 
 
 
327 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  60.92 
 
 
327 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  63.08 
 
 
327 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  61.44 
 
 
329 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  59.49 
 
 
339 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  61.54 
 
 
327 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  60 
 
 
346 aa  361  8e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  61.54 
 
 
327 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  61.23 
 
 
327 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  60.62 
 
 
327 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  61.23 
 
 
327 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  61.23 
 
 
327 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  57.19 
 
 
333 aa  359  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  61.23 
 
 
327 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  59.94 
 
 
335 aa  357  1e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  57.36 
 
 
326 aa  355  7e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  56.48 
 
 
325 aa  352  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  58.6 
 
 
324 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 
330 aa  352  7e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  58.15 
 
 
333 aa  350  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  55.9 
 
 
323 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  61.76 
 
 
332 aa  349  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.2508e-05  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  56.97 
 
 
325 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  55.35 
 
 
329 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  56.37 
 
 
324 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  55.42 
 
 
330 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  55.84 
 
 
326 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  55.41 
 
 
323 aa  343  3e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  56.69 
 
 
345 aa  342  6e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  56.69 
 
 
345 aa  342  6e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  57.1 
 
 
328 aa  342  6e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  58.23 
 
 
330 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  54.63 
 
 
324 aa  339  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  55.73 
 
 
324 aa  338  6e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 
324 aa  338  6e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  58.54 
 
 
341 aa  338  6e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 
324 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 
324 aa  337  2e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  54.46 
 
 
323 aa  335  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  54.14 
 
 
344 aa  335  6e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  52.78 
 
 
325 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  52.87 
 
 
326 aa  332  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  55.1 
 
 
324 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  53.4 
 
 
325 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 
323 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  52.47 
 
 
325 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  52.16 
 
 
325 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.87 
 
 
324 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  52.16 
 
 
325 aa  329  5e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  52.47 
 
 
325 aa  328  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  51.86 
 
 
324 aa  328  6e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  51.71 
 
 
324 aa  327  1e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  52.06 
 
 
321 aa  328  1e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  53.5 
 
 
324 aa  327  2e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  54.14 
 
 
326 aa  327  2e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  52.16 
 
 
325 aa  327  2e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.23 
 
 
325 aa  327  2e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  55.27 
 
 
328 aa  327  2e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.95 
 
 
328 aa  326  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  54.89 
 
 
330 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  51.85 
 
 
325 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  52.16 
 
 
325 aa  325  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  54.63 
 
 
321 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47451e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  51.23 
 
 
325 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  51.23 
 
 
325 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  51.23 
 
 
325 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  51.23 
 
 
325 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  51.85 
 
 
325 aa  322  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  51.85 
 
 
325 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  54.09 
 
 
321 aa  322  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>