More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4062 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  75.2 
 
 		 252 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  74.8 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  76.35 
 
 		 261 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  74.69 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  72.92 
 
 		 246 aa  361  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  64.46 
 
 		 243 aa  320  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  65.7 
 
 		 242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  64.46 
 
 		 244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.85 
 
 		 244 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  63.52 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  64.05 
 
 		 245 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  64.05 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  63.33 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2076  ABC transporter related  65.42 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.701263  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  64.44 
 
 		 241 aa  314  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.3 
 
 		 245 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  61.54 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  62.81 
 
 		 243 aa  311  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  62.3 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  63.37 
 
 		 249 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  61.89 
 
 		 245 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  62.96 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  61.57 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  63.18 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.98 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  61.98 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0880  ABC transporter related  61.16 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3973  ABC transporter related  61.41 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.295954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  61.16 
 
 		 247 aa  305  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  60.74 
 
 		 247 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2441  ABC transporter related  61.34 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  62.34 
 
 		 506 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4668  ABC transporter related  62.08 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  58.02 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  56.25 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  58.26 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.8 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  54.03 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4926  ABC transporter related  58.58 
 
 		 244 aa  278  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.38 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0176  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  54.79 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  57.38 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  55.88 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  58.51 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  59.24 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.25 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  58.33 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.47 
 
 		 263 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1030  ABC transporter related  57.2 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000180087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  56.3 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  56.96 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  56.36 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  56.49 
 
 		 243 aa  269  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.49 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.72 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  56.54 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.72 
 
 		 241 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 241 aa  268  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1599  ABC transporter related  56.97 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  55 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3129  ABC transporter related  57.68 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.46772  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  53.78 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  54.25 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4140  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  53.75 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  54.01 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  56.1 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  55.6 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  53.75 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  53.25 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  54.69 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  54.96 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.96 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1706  ABC transporter related  58.75 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  57.26 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  52.28 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  54.88 
 
 		 266 aa  264  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  57.32 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  56.54 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>