More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4054 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  47.34 
 
 		 1637 aa  1189    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  47.12 
 
 		 1643 aa  1145    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  46.8 
 
 		 1629 aa  1154    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 		 1726 aa  1067    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  47.95 
 
 		 1636 aa  1234    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  46.45 
 
 		 1649 aa  1102    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  53.75 
 
 		 1788 aa  1386    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 1756 aa  3493    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.29 
 
 		 1780 aa  623  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.73 
 
 		 1780 aa  568  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.8 
 
 		 1808 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  30.77 
 
 		 1809 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.66 
 
 		 1901 aa  553  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.45 
 
 		 1795 aa  550  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.23 
 
 		 1774 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.28 
 
 		 1794 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.96 
 
 		 2051 aa  542  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  25.84 
 
 		 1850 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 1914 aa  536  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 1932 aa  536  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 		 1805 aa  533  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.01 
 
 		 1797 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.12 
 
 		 1845 aa  529  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30.36 
 
 		 1833 aa  529  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.34 
 
 		 1804 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  31.01 
 
 		 1837 aa  522  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.14 
 
 		 1832 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 1908 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.72 
 
 		 1805 aa  516  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  31 
 
 		 1922 aa  504  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  27.58 
 
 		 1934 aa  503  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 2077 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.11 
 
 		 2109 aa  497  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.45 
 
 		 2361 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  28.25 
 
 		 1712 aa  479  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.78 
 
 		 2017 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.96 
 
 		 1836 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  27.18 
 
 		 2303 aa  457  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.26 
 
 		 1663 aa  459  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  27.35 
 
 		 1697 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  27.48 
 
 		 2279 aa  452  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.44 
 
 		 1668 aa  453  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4044  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.44 
 
 		 652 aa  453  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.341378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 1942 aa  452  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.74 
 
 		 2272 aa  445  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4046  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  80.07 
 
 		 503 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  75.34 
 
 		 588 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.41 
 
 		 1822 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.91 
 
 		 1871 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 		 1644 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1739 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  35.27 
 
 		 1885 aa  386  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  28.89 
 
 		 1811 aa  386  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.37 
 
 		 1685 aa  386  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.72 
 
 		 1797 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.08 
 
 		 1685 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.95 
 
 		 1748 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4554  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  64.38 
 
 		 604 aa  363  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.69 
 
 		 1744 aa  355  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2944  sensor histidine kinase  63.45 
 
 		 604 aa  347  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.76 
 
 		 604 aa  345  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 670 aa  343  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6103  histidine kinase  56.33 
 
 		 365 aa  340  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  37.67 
 
 		 1885 aa  335  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.53 
 
 		 1710 aa  332  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1914  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.25 
 
 		 516 aa  322  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.45 
 
 		 1685 aa  308  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  53.54 
 
 		 1453 aa  306  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.35 
 
 		 1254 aa  286  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.55 
 
 		 1682 aa  284  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.46 
 
 		 1682 aa  284  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.72 
 
 		 1211 aa  284  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 1004 aa  280  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 		 1295 aa  280  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 737 aa  275  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1011  two component signal transduction sensor  41.8 
 
 		 737 aa  259  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.880836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0163  histidine kinase  41.84 
 
 		 497 aa  249  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 651 aa  233  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0452566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0330  hypothetical protein  40.28 
 
 		 471 aa  199  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  40.48 
 
 		 471 aa  198  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 1123 aa  180  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.94 
 
 		 1473 aa  163  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 		 1473 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 		 1473 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 494 aa  150  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  27.6 
 
 		 1774 aa  146  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  21.91 
 
 		 1112 aa  144  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 1235 aa  139  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  21.81 
 
 		 1123 aa  136  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  25.42 
 
 		 1064 aa  130  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5522  histidine kinase  30.46 
 
 		 423 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.989715  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.2 
 
 		 594 aa  122  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.45 
 
 		 676 aa  120  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  40.13 
 
 		 661 aa  120  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  21.43 
 
 		 1060 aa  118  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 615 aa  118  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.99 
 
 		 613 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 598 aa  115  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.57 
 
 		 681 aa  115  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  36.94 
 
 		 618 aa  115  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>