More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3864 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  69.23 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  65.02 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  60.93 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  61.92 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  61.92 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  60.91 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  60.26 
 
 		 302 aa  344  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  44.44 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  44.65 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  45.74 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  41.72 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  41.72 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  41.39 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  41.39 
 
 		 918 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  40.48 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  40.14 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  39.8 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  41.08 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.33 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  37.46 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.33 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.73 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  35.81 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  36.95 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  37.46 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  38.13 
 
 		 282 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  36.58 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.27 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.27 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.77 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  36.15 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  33.11 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  30.41 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.67 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.38 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.45 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  31.35 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  33.09 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  34.32 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  32.88 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  30.83 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  29.08 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  33.44 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  31.43 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  34.34 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  30.9 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.23 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  31.32 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.78 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.23 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  32.67 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  31.89 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.56 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  34.21 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.32 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.55 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  30.33 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2496  thioredoxin  37.35 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  30.77 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  31.79 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.97 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  30.49 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  30.65 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  31.61 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  28.86 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  33.11 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  30.46 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  30.25 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  33.01 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  29.9 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  29.9 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  32.78 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  31.27 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  32.01 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  30.59 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.72 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  31.88 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.64 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  30.97 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  28.05 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  29.79 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  30.87 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  30.1 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  30.29 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  27.85 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  31.01 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  31.01 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  29.87 
 
 		 274 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  31.01 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  31.01 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  30.23 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  31.23 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  31.01 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  31.01 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  31.01 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>