More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3828 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  61.74 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  62.21 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.33 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  66.45 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  66.45 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  63.91 
 
 		 308 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  63.91 
 
 		 308 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  63.91 
 
 		 308 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  63.91 
 
 		 308 aa  363  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  63.58 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1714  hypothetical protein  68.4 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.100165  hitchhiker  0.0002003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  38.91 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  36.57 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  37.66 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  37.22 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  36.89 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  36.57 
 
 		 316 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  36.57 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  36.57 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  36.57 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  36.57 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  36.89 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  36.93 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0050  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.71429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  28.37 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.21 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  31.53 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  30.27 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.52 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.52 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  31.1 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.55 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.19 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.95 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  29.55 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.52 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.19 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.62 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.1 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.1 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.87 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.87 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  30.19 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  29.26 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  28.79 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.69 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  30.09 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  25.09 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.03 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  31.33 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  27.46 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  29.39 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  24.32 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  29.68 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  28.91 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.37 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  28.81 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  29.22 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  26.36 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  26.44 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.13 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  24.16 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  26.32 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  26.62 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.27 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  26.86 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.09 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  29.38 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28.29 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  29.01 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.09 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.09 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  26.91 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  24.47 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.9 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>