More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3722 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  80.22 
 
 		 274 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  62.5 
 
 		 283 aa  333  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  61.63 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  56.78 
 
 		 260 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  57.38 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  57.38 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  57.74 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  54.1 
 
 		 314 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2010  hypothetical protein  34.02 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.949714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  30.48 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  25.91 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  25.91 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  27.9 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  24.47 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  26.89 
 
 		 1200 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  36.61 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  55.1 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  24.14 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  27.27 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0997  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 1031 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  69.7 
 
 		 896 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1651  hypothetical protein  77.78 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  30.65 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  52.94 
 
 		 837 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  77.78 
 
 		 888 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1274  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 1029 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.128332  normal  0.146053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 593 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2179  SecC motif-containing protein  73.33 
 
 		 111 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  71.88 
 
 		 872 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 864 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 845 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3412  ATPase  75 
 
 		 110 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.0425953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  60 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  69.7 
 
 		 962 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  47.73 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  50 
 
 		 535 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  69.7 
 
 		 962 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  60 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  69.7 
 
 		 962 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  65.62 
 
 		 848 aa  52.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2575  hypothetical protein  77.78 
 
 		 110 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181837  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 866 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0271  preprotein translocase, SecA subunit  40.85 
 
 		 1102 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.838205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 844 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  95 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3867  SecC motif-containing protein  70.97 
 
 		 110 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.137158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  34.75 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  67.74 
 
 		 897 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  36.44 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  36.44 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  63.41 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  69.7 
 
 		 944 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  61.54 
 
 		 166 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 921 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  62.86 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  62.16 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 834 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  43.75 
 
 		 858 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  44.23 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  64.52 
 
 		 838 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0915  SecC motif-containing protein  67.74 
 
 		 112 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0667  SEC-C motif domain protein  52.78 
 
 		 421 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105843  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  66.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1324  SecC motif-containing protein  66.67 
 
 		 111 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  53.49 
 
 		 800 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2874  metal-binding protein  67.74 
 
 		 112 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  95 
 
 		 167 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  25.2 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  66.67 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  90 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  72 
 
 		 836 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  75.76 
 
 		 1004 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  73.08 
 
 		 896 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0460  SEC-C motif domain protein  39.78 
 
 		 156 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  46.51 
 
 		 958 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  25.2 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  25.2 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  69.23 
 
 		 912 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  53.33 
 
 		 921 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  58.97 
 
 		 170 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  25.2 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  25.2 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  85 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 837 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2413  SecC motif-containing protein  90 
 
 		 319 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  58.06 
 
 		 61 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1048  SecC motif-containing protein  95 
 
 		 161 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  75.86 
 
 		 910 aa  48.9  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4599  preprotein translocase, SecA subunit  64.71 
 
 		 970 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.723013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  68 
 
 		 957 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3510  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 		 112 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.385858  hitchhiker  0.0042678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 859 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3289  SecC motif-containing protein  37.65 
 
 		 112 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000735238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  64.52 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0576  preprotein translocase subunit SecA  73.91 
 
 		 855 aa  48.5  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.116184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>