185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3703 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3703  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
220 aa  456  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.393937  normal  0.783834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4488  DSBA oxidoreductase  75.12 
 
 
220 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0775  DSBA oxidoreductase  60.63 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0334  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.227367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0345  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0416  DSBA oxidoreductase  57.41 
 
 
218 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.681014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0575  DSBA oxidoreductase  55.76 
 
 
223 aa  248  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484961  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0671  DSBA oxidoreductase  57.14 
 
 
216 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  50.23 
 
 
215 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  51.1 
 
 
221 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0151  thiol:disulfide interchange protein  48.85 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.517517  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  46.12 
 
 
214 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1975  DSBA oxidoreductase  46.08 
 
 
215 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  45.6 
 
 
211 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  46.15 
 
 
212 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4247  putative thiol-disulfide interchange protein  44.26 
 
 
212 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0471  DSBA oxidoreductase  40.78 
 
 
212 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0186  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.78 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.27 
 
 
212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 
213 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 
213 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0383  DSBA oxidoreductase  40.93 
 
 
212 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.290436 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1684  DSBA oxidoreductase  42.16 
 
 
215 aa  169  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2454  DSBA oxidoreductase  39.49 
 
 
215 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  40.98 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  41.21 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  41.21 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  40.66 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0135  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0143  DSBA oxidoreductase  39.47 
 
 
218 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.15 
 
 
216 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.32 
 
 
216 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0285  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  37.85 
 
 
218 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3864  twin-arginine translocation pathway signal  40.09 
 
 
218 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.387076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.05 
 
 
211 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.41 
 
 
211 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
211 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  36.92 
 
 
210 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01990  Thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.92 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  36.45 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2116  DSBA oxidoreductase  34.58 
 
 
213 aa  142  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2675  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  35.52 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0052  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
213 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  33.17 
 
 
206 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0341  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.68 
 
 
214 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0268  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
214 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0158  DSBA oxidoreductase  35.82 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.699641  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0898  thiol:disulfide interchange signal peptide protein  34.36 
 
 
225 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0722  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
208 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0037  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 
210 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.763782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2850  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
211 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302061  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  32.98 
 
 
293 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04434  thiol:disulfide interchange protein  34.22 
 
 
271 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04433  disulfide oxidoreductase  34.78 
 
 
216 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0557  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.57 
 
 
213 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3404  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
216 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  0.487769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3405  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 
275 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0693  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33027  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0780  thiol:disulfide interchange protein  30.65 
 
 
260 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0692  DSBA oxidoreductase  30.85 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.487009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0779  thiol:disulfide interchange protein  30.32 
 
 
215 aa  92  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
206 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
206 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.51 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  30.5 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  30.48 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
207 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0435  DSBA oxidoreductase  23.66 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 
207 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0137  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  26.98 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0122  thiol:disulfide interchange protein precursor DsbA  26.98 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.96 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.89 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  27.96 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  24.65 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.98 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.11 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  27.96 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>