More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3693 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  100 
 
 
357 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  84.83 
 
 
356 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  57.89 
 
 
355 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  54.05 
 
 
369 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  53.35 
 
 
371 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  53.08 
 
 
371 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  54.77 
 
 
386 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  53.26 
 
 
389 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  52.8 
 
 
371 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  52.67 
 
 
371 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  53.1 
 
 
371 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  54.32 
 
 
360 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  54.08 
 
 
372 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  55.73 
 
 
372 aa  358  6e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  52.72 
 
 
384 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  53.26 
 
 
381 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  53.55 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  53.55 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  53.93 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  52.97 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  53.93 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  52.45 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  53.95 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  53.95 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  53.95 
 
 
372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.22 
 
 
372 aa  355  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  51.98 
 
 
376 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  51.78 
 
 
386 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  53.37 
 
 
370 aa  355  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.01 
 
 
379 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  53.55 
 
 
371 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  54.01 
 
 
379 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  52.86 
 
 
386 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
372 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
372 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
372 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
372 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.62 
 
 
372 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 
372 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  52.65 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.49 
 
 
352 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  51.51 
 
 
386 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  51.54 
 
 
356 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  53.06 
 
 
357 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.22 
 
 
371 aa  351  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  53.95 
 
 
371 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  51.33 
 
 
373 aa  348  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  52.22 
 
 
359 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  52.96 
 
 
371 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  49.58 
 
 
355 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  51.89 
 
 
368 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  49.58 
 
 
385 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.05 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.27 
 
 
372 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  51.09 
 
 
363 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  50.94 
 
 
363 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  50.84 
 
 
357 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  48.65 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 
369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  50.68 
 
 
363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  49.3 
 
 
355 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  49.72 
 
 
360 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  49.58 
 
 
351 aa  338  9e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  51.09 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.43 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  50.56 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  52.02 
 
 
368 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.3 
 
 
355 aa  335  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  48.35 
 
 
362 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  50.28 
 
 
361 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  48.86 
 
 
333 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  48.74 
 
 
355 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  47.27 
 
 
365 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.63 
 
 
380 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.27 
 
 
373 aa  331  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  49.58 
 
 
352 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  50 
 
 
356 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  48.61 
 
 
356 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.6 
 
 
359 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  50.14 
 
 
354 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0645  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.27 
 
 
354 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.366147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  49.3 
 
 
352 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  48.35 
 
 
356 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  49.72 
 
 
353 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  48.74 
 
 
355 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  48.6 
 
 
359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  47.18 
 
 
375 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  49.17 
 
 
354 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  48.06 
 
 
379 aa  328  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  48.89 
 
 
354 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.14 
 
 
368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.65 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.66 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  54.69 
 
 
357 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.11 
 
 
381 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  46.88 
 
 
367 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  47.44 
 
 
384 aa  325  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  49.86 
 
 
357 aa  326  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  48.32 
 
 
353 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>