More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3580 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  100 
 
 
172 aa  330  7.000000000000001e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  70.66 
 
 
189 aa  234  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  69.64 
 
 
185 aa  226  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  72.19 
 
 
186 aa  214  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  66.86 
 
 
188 aa  203  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  62.94 
 
 
197 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  65.32 
 
 
209 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  50.87 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  54.71 
 
 
178 aa  170  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  50.29 
 
 
189 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.13 
 
 
184 aa  167  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  51.45 
 
 
186 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  50.87 
 
 
186 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  53.89 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  48.24 
 
 
186 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  50 
 
 
186 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  48.24 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  48.24 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  48.24 
 
 
186 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  48.24 
 
 
186 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  47.27 
 
 
182 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  47.65 
 
 
186 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  48.55 
 
 
195 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  49.4 
 
 
174 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  45.66 
 
 
193 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  44.83 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  45.88 
 
 
184 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  49.13 
 
 
206 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  46.86 
 
 
203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  48.55 
 
 
187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  47.4 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  43.37 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  45.71 
 
 
190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  42.77 
 
 
176 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  42.77 
 
 
176 aa  120  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  43.93 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  48.3 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  47.31 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  42.78 
 
 
203 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  46.15 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  41.71 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  37.87 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  40 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  39.29 
 
 
178 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  37.78 
 
 
222 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  37.78 
 
 
199 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  41.82 
 
 
182 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  39.64 
 
 
187 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  41.52 
 
 
188 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  40.48 
 
 
190 aa  104  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  41.52 
 
 
188 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  42.2 
 
 
188 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.9 
 
 
196 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  39.88 
 
 
210 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  38.15 
 
 
177 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  38.15 
 
 
181 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.1 
 
 
180 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  37.06 
 
 
182 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  37.06 
 
 
182 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  46.67 
 
 
197 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  43.79 
 
 
183 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  40.96 
 
 
174 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.96 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  40.96 
 
 
175 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  40 
 
 
188 aa  99  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  37.72 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  40.36 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.31 
 
 
181 aa  97.4  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  38.24 
 
 
193 aa  96.7  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.13 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  34.68 
 
 
183 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  32.74 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  41.86 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  39.41 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  34.04 
 
 
187 aa  95.5  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  37.43 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.46 
 
 
416 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  34.68 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  34.1 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  37.95 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  40.12 
 
 
178 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  36.31 
 
 
191 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  34.68 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  37.95 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  37.35 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.12 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  41.07 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  35.71 
 
 
191 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  36.69 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  42.42 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3664  cytochrome B561  44.05 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000237228  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  39.41 
 
 
179 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  40.23 
 
 
186 aa  91.3  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  32.95 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>