47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3541 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3541  ATPase-like protein  100 
 
 		 426 aa  869    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1041  ATPase-like  55.63 
 
 		 447 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0741  putative phage resistance protein  36.72 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0995  RloA protein  33.71 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1557  hypothetical protein  34.93 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0298  putative phage resistance protein  33.1 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2208  hypothetical protein  32.64 
 
 		 422 aa  206  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11638  abortive infection protein, putative  32.43 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2064  hypothetical protein  34.33 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.906065  normal  0.239178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2148  hypothetical protein  32.2 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0050  hypothetical protein  30.7 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12600  hypothetical protein  28.73 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1294  hypothetical protein  30.94 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3791  abortive phage resistance protein-like  28.7 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.618475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1920  abortive phage resistance protein-like  28.48 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000340563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7388  hypothetical protein  29.86 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0903  hypothetical protein  29.37 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1074  abortive phage resistance protein-like protein  29.61 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1784  ATPase-like protein  28.82 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00463649  normal  0.498848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4361  hypothetical protein  27.54 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2870  hypothetical protein  28.25 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.716536  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0079  abortive infection protein, putative  28.48 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1948  abortive phage resistance protein-like protein  25 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2132  abortive infection protein, putative  24.95 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.903649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3302  hypothetical protein  36.18 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1899  abortive infection protein, internal deletion  25.28 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136383  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1118  SMC domain-containing protein  25.35 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.266234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1616  abortive infection protein, internal deletion  23.67 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3995  abortive infection protein, internal deletion  23.02 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2991  abortive infection protein  23.58 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0164345  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2166  AAA ATPase  31.25 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000280978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0733  hypothetical protein  23.31 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00594005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3852  abortive infection protein  21.18 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000425466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  30.71 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.59 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0024  recombination protein RecR  31.71 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000424013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4229  abortive infection protein  29.51 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0493  abortive infection protein  22.67 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1573  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 		 373 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0501523  normal  0.47865 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2014  hypothetical protein  30.41 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0054  abortive infection protein  21.55 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4680  hypothetical protein  28.42 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.105377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  24.73 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1530  abortive infection protein  32.86 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00764911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  25.81 
 
 		 582 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  38.2 
 
 		 572 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  24.45 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>