13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3540 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  50.72 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  37.09 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  29.49 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  35 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  29.58 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  28.84 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  27.35 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  27.8 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  23.44 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  27.56 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>