More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3526 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  758    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  82.12 
 
 
325 aa  498  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  73.33 
 
 
330 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  78.16 
 
 
333 aa  485  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  73.33 
 
 
330 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  66.97 
 
 
327 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  73.49 
 
 
331 aa  441  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  52.35 
 
 
349 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  49.68 
 
 
333 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  48.99 
 
 
339 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  50.16 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.84 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.08 
 
 
322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  48.66 
 
 
334 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.67 
 
 
337 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.18 
 
 
331 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.05 
 
 
339 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  46.51 
 
 
339 aa  282  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.25 
 
 
345 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.25 
 
 
345 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.84 
 
 
327 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.07 
 
 
336 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.52 
 
 
330 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.48 
 
 
330 aa  267  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
328 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.63 
 
 
360 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  41.53 
 
 
332 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  42.94 
 
 
342 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.97 
 
 
339 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.78 
 
 
333 aa  262  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.15 
 
 
339 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 
328 aa  262  8.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  43.05 
 
 
334 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  44.52 
 
 
325 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.72 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.46 
 
 
333 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  41.81 
 
 
328 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.28 
 
 
336 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  44.07 
 
 
323 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.9 
 
 
336 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.9 
 
 
322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  43.52 
 
 
322 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.38 
 
 
324 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.93 
 
 
333 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.19 
 
 
325 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  42.48 
 
 
334 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.18 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  40.52 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.48 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.19 
 
 
326 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.31 
 
 
325 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  44.3 
 
 
331 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.3 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  39.76 
 
 
332 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.13 
 
 
331 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  41.18 
 
 
324 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.32 
 
 
339 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.19 
 
 
328 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.25 
 
 
327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  40.8 
 
 
326 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.72 
 
 
314 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  40.33 
 
 
332 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  43.28 
 
 
332 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  41.14 
 
 
337 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.79 
 
 
349 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  42.68 
 
 
330 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  42.47 
 
 
321 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.22 
 
 
335 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.94 
 
 
328 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.19 
 
 
331 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.61 
 
 
356 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.85 
 
 
322 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  39.35 
 
 
327 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  41.69 
 
 
344 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  41.69 
 
 
341 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.87 
 
 
328 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  44.75 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  42.36 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.61 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.27 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  41.37 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.59 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  41.59 
 
 
330 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.32 
 
 
344 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.32 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  38.72 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  42.03 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 
331 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.09 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.94 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  41.39 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  42.16 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.86 
 
 
327 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.81 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.53 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.2 
 
 
339 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  42 
 
 
326 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>