More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3485 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 310 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 312 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.15 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  35.59 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.66 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.23 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  34.86 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  30.34 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  34.91 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  36.12 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  30.7 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 234 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 1171 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  28.89 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  28.29 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.31 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.7 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.13 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.36 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 672 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  35.4 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  33.63 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  24.66 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.16 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.16 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.16 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 597 aa  62.4  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  24.9 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  28.21 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  27.66 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.59 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 1035 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.19 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.73 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  35.19 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>