More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3275 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  590  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  76.74 
 
 		 301 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.67 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0373  hypothetical protein  51.88 
 
 		 295 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.88 
 
 		 295 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0758833  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  54.55 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  55.27 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  50.18 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  47.32 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  38.68 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  37.15 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  36.62 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  37.41 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5188  hypothetical protein  37.54 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0422445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  34.97 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  34.97 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  34.97 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  34.07 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  33.22 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  34.74 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  34.27 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.13 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  37.68 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  35.38 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  34.43 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  36.65 
 
 		 288 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  34.66 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  34.53 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  34.66 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  33.09 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.13 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  32.97 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.37 
 
 		 317 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  30.87 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  32.47 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.99 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  31.32 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  32 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.95 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.8 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3465  hypothetical protein  31.61 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.14 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  30.3 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.72 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  32.76 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.42 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  30.58 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.38 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.56 
 
 		 342 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.82 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.47 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  28.2 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  28.28 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  28.28 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  29.45 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.67 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1260  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.26 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.581143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  29.84 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28.27 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  30.5 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  27.83 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.35 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  26.58 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  29.6 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06291  hypothetical protein  29.33 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  27.94 
 
 		 305 aa  90.1  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  26.35 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.3 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  30.43 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  26.98 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  29.78 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0618  hypothetical protein  28.01 
 
 		 338 aa  86.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  29.47 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0617  hypothetical protein  28.01 
 
 		 338 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  29.14 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  28.42 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001435  putative transporter DME family  31.22 
 
 		 285 aa  85.9  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  27.34 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  31.88 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  28.38 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  28.38 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.11 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  28.38 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.923959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>