More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3132 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  50.47 
 
 		 751 aa  695    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  49.32 
 
 		 755 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  46.25 
 
 		 746 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  48.6 
 
 		 750 aa  699    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  84 
 
 		 747 aa  1162    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  100 
 
 		 747 aa  1496    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  47.59 
 
 		 746 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  47.51 
 
 		 746 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  47.37 
 
 		 746 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  47.37 
 
 		 746 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  45.58 
 
 		 764 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  46.85 
 
 		 755 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  45.89 
 
 		 745 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  45.61 
 
 		 745 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  45.47 
 
 		 745 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  44.26 
 
 		 747 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  42.46 
 
 		 747 aa  592  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  42.82 
 
 		 746 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  44.31 
 
 		 734 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  41.91 
 
 		 748 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  43.99 
 
 		 740 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  43.78 
 
 		 764 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  44.28 
 
 		 730 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  41.55 
 
 		 736 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  41.31 
 
 		 736 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  40.96 
 
 		 740 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  40.55 
 
 		 740 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  41.94 
 
 		 757 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  39.92 
 
 		 744 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  40.31 
 
 		 721 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  42.78 
 
 		 747 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  42.95 
 
 		 746 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  42.15 
 
 		 745 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  43.21 
 
 		 749 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  41.01 
 
 		 735 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  39.15 
 
 		 740 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  39.78 
 
 		 741 aa  492  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  39.39 
 
 		 753 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  38.71 
 
 		 716 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  39.77 
 
 		 744 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  40.34 
 
 		 744 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  37.95 
 
 		 759 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  37.71 
 
 		 723 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  41.94 
 
 		 755 aa  479  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  36.24 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.8 
 
 		 726 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  35.97 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  36.11 
 
 		 720 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  35.97 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  35.84 
 
 		 720 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  35.84 
 
 		 720 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  35.97 
 
 		 720 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  37.53 
 
 		 727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  36.22 
 
 		 724 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  35.97 
 
 		 720 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  37.1 
 
 		 739 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  37.8 
 
 		 734 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.35 
 
 		 741 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  36.96 
 
 		 739 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.23 
 
 		 741 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  36.43 
 
 		 719 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  36.96 
 
 		 739 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  36.43 
 
 		 719 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  36.43 
 
 		 719 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  36.43 
 
 		 719 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  36.83 
 
 		 739 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  39.86 
 
 		 754 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  37.35 
 
 		 741 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  37.83 
 
 		 726 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.67 
 
 		 736 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  36.94 
 
 		 741 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  37.58 
 
 		 741 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  40.92 
 
 		 760 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.58 
 
 		 741 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  35.05 
 
 		 720 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  37.58 
 
 		 741 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  36.25 
 
 		 723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  36.43 
 
 		 719 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  37.9 
 
 		 745 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.63 
 
 		 760 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  35.75 
 
 		 722 aa  437  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.55 
 
 		 730 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  36.29 
 
 		 740 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  35.96 
 
 		 731 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  35.46 
 
 		 732 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  38.62 
 
 		 721 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.3 
 
 		 726 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.3 
 
 		 726 aa  415  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  32.91 
 
 		 724 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.96 
 
 		 726 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  35.43 
 
 		 733 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  31.62 
 
 		 802 aa  364  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  30.29 
 
 		 753 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.16 
 
 		 780 aa  349  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>