103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2966 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
266 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  37.66 
 
 
282 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  37.45 
 
 
285 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  31.2 
 
 
275 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  30.51 
 
 
273 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  29.66 
 
 
273 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  33.05 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  28.41 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  28.74 
 
 
378 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  28.74 
 
 
378 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  31.56 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  27.53 
 
 
292 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  28.86 
 
 
864 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  27.71 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  28.92 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  27.13 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  27.13 
 
 
300 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  27.13 
 
 
293 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  31.58 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  30.31 
 
 
253 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  29.32 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  27.45 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  26.32 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  28.1 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  28.05 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  30.39 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  29.15 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  30.04 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  25.61 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  25.61 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  26.32 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  30.89 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  27.94 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  27.24 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  28.39 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  29.24 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  26.56 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.18 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  29.26 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  29.41 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  28.04 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  24.48 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  25.79 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  24.9 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  28.86 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  26.37 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  28.11 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  28.11 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  28.11 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  28.11 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  28.11 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  23.6 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  29.55 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  27.71 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  30.84 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  24.14 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  24.12 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  23.72 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  31.31 
 
 
270 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  27.78 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  26.98 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  25.4 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  27.31 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  26.64 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  24.05 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  36.19 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  27.43 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  26.42 
 
 
288 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  25.62 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  25.62 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  24.62 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  27 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  23.64 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  23.64 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  23.64 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  23.64 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  23.64 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  23.98 
 
 
274 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  23.97 
 
 
248 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  25.2 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  23 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  26.21 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  26.21 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  26.21 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  26.39 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  35.79 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  23.55 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  24.51 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  27.39 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  22.26 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  23.55 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>