119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2836 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  84.38 
 
 		 397 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  793    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  78.34 
 
 		 397 aa  627  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  76.32 
 
 		 397 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  79.26 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  73.32 
 
 		 401 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  73.32 
 
 		 401 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  73.32 
 
 		 401 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  73 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  72.5 
 
 		 399 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  72.82 
 
 		 401 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  72.82 
 
 		 401 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  72.32 
 
 		 401 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  72.32 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  74.25 
 
 		 399 aa  559  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  71.57 
 
 		 401 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  72.07 
 
 		 401 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  69.83 
 
 		 401 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  69.5 
 
 		 400 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  67 
 
 		 400 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  70 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  67.67 
 
 		 400 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  42.25 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  42.25 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  40.25 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  43 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  43.39 
 
 		 399 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.61 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  39.65 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  43.14 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  35.09 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  36.06 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  25.94 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.76 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  25.31 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  25.12 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  25.37 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.2 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  25.12 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  25.61 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  25.06 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  25.06 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.78 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  22.96 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  22.96 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  22.84 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  24.82 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  21.48 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  21.7 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  21.57 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  21.57 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25.54 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  23.26 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  24.12 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  20.58 
 
 		 356 aa  57  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  20.79 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  21.39 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  21.53 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  27.37 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  27.62 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  28.24 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  21.39 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  27.22 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  23.93 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  29.82 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  32.73 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  22.99 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  21.57 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.27 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  22.3 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  21.51 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  23.67 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.5 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  27.21 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  27.21 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1005  ABC transporter, permease protein  21.43 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  27.93 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1744  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  30.17 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  19.56 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>