31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2833 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2833  OsmC family protein  100 
 
 
158 aa  324  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.829807  hitchhiker  0.00176763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3747  OsmC family protein  66.22 
 
 
148 aa  203  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49110  redox protein  60 
 
 
153 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1205  OsmC family protein  42.25 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274132  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1365  OsmC family protein  42.25 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2284  OsmC family protein  42.25 
 
 
147 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3777  OsmC family protein  42.36 
 
 
162 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.358184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1144  OsmC family protein  40.85 
 
 
147 aa  123  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4182  OsmC family protein  39.6 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2200  OsmC family protein  43.97 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1521  hypothetical protein  43.62 
 
 
155 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.483941  normal  0.516484 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0042  OsmC family protein  38.64 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  29.92 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  32.71 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1183  hypothetical protein  47.92 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  28.68 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  35.09 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  39.13 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0557  OsmC family protein  28.43 
 
 
125 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.172009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4658  hypothetical protein  24.6 
 
 
125 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  hitchhiker  7.91751e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0701  hypothetical protein  29.13 
 
 
125 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0555  OsmC-like protein  27.18 
 
 
125 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000799335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  52.5 
 
 
412 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0556  OsmC-like protein  29.13 
 
 
125 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0644  hypothetical protein  28.16 
 
 
125 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000573251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0611  hypothetical protein  28.16 
 
 
125 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000492756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  50 
 
 
413 aa  41.2  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  31.25 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0712  hypothetical protein  24.6 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000905109  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1457  OsmC-like protein  26.6 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  29.41 
 
 
132 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>