More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2743 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  100 
 
 
227 aa  465  1e-130  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  58.1 
 
 
217 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  38.8 
 
 
212 aa  152  3e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.1 
 
 
223 aa  140  2e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  38.22 
 
 
222 aa  139  4e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  43.26 
 
 
230 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  38.22 
 
 
223 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  42.22 
 
 
204 aa  135  6e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  40.66 
 
 
228 aa  134  1e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  40.33 
 
 
228 aa  131  7e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  37.56 
 
 
221 aa  131  8e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  40.33 
 
 
228 aa  130  1e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  37.56 
 
 
221 aa  131  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  36.55 
 
 
221 aa  130  1e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  38.07 
 
 
221 aa  130  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  40.33 
 
 
242 aa  130  2e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  37.06 
 
 
221 aa  129  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.7 
 
 
228 aa  129  4e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  37.06 
 
 
221 aa  129  4e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  35.65 
 
 
221 aa  129  5e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  36.41 
 
 
221 aa  128  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 
248 aa  128  8e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  33.96 
 
 
222 aa  127  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  39.78 
 
 
228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  34.24 
 
 
223 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.11 
 
 
232 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  34.87 
 
 
221 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  34.87 
 
 
221 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  34.87 
 
 
221 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0436  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.81 
 
 
226 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  34.87 
 
 
221 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  34.87 
 
 
221 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  37.36 
 
 
222 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  34.82 
 
 
225 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  36.04 
 
 
227 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.88 
 
 
231 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  36.31 
 
 
224 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.87 
 
 
221 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  32.55 
 
 
237 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  40.11 
 
 
218 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
235 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  37.22 
 
 
215 aa  121  1e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  35.2 
 
 
208 aa  120  1e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  39.89 
 
 
217 aa  120  1e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.17 
 
 
228 aa  119  4e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  34.81 
 
 
218 aa  119  5e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  37.7 
 
 
225 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  39.2 
 
 
217 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  37.57 
 
 
219 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  35.6 
 
 
229 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.9 
 
 
223 aa  117  2e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  36.65 
 
 
245 aa  116  4e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  38.67 
 
 
223 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3747  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.55 
 
 
229 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.422409  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.85 
 
 
232 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  36.04 
 
 
221 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 
214 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.85 
 
 
229 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  36.98 
 
 
219 aa  115  7e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  36.73 
 
 
216 aa  114  1e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.08 
 
 
223 aa  114  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.76 
 
 
219 aa  114  2e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  34.44 
 
 
233 aa  114  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4274  6-phosphogluconate phosphatase  33.5 
 
 
221 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  34.27 
 
 
222 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3445  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.75 
 
 
229 aa  110  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4240  6-phosphogluconate phosphatase  33.33 
 
 
222 aa  110  2e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  41.11 
 
 
227 aa  110  2e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4188  6-phosphogluconate phosphatase  34.01 
 
 
222 aa  109  4e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274934  hitchhiker  0.00681346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  35.27 
 
 
230 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  32.78 
 
 
230 aa  105  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  35.98 
 
 
230 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  35.48 
 
 
230 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  33.89 
 
 
228 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  33.89 
 
 
228 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  32.77 
 
 
246 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  32.77 
 
 
224 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
230 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2538  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.77 
 
 
241 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.95 
 
 
229 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  34.13 
 
 
224 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  33.86 
 
 
229 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3004  HAD family hydrolase  37.35 
 
 
214 aa  98.6  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.293742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.17 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  34.9 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4594  6-phosphogluconate phosphatase  33.5 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.348928  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  35 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.52 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.9 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  35.12 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.12 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  31.38 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  30.15 
 
 
252 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>