More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2638 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 344 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  46.55 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  46.26 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  45.2 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  43.06 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  42.7 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  39.49 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.06 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  35.34 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  35.06 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  36.73 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  36.01 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  43.42 
 
 		 264 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  33.56 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  34.72 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  31.89 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  35.96 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  34.72 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  34.15 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.97 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.88 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  31.38 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  32.97 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  30.75 
 
 		 380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  29.25 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  39.1 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  32.37 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  35.99 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  32.85 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  32.86 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  34.9 
 
 		 386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.78 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  31.37 
 
 		 348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.22 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  31.6 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.25 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.07 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  29.77 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  26.85 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  34.26 
 
 		 304 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.79 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.1 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.66 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  27.4 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  32.69 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  28.67 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  35.81 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.09 
 
 		 339 aa  125  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  33.93 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.51 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  29.33 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.25 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  32.11 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.6 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.96 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  31.23 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  35.56 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  24.5 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.79 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.01 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32.23 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  30 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  31.58 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  30.91 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.87 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.33 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.33 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.33 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.78 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.9 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.7 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  30.26 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  32.05 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  32.05 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  29.35 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.67 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  32.05 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.1 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.08 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.67 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.43 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  31.51 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.45 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.09 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>