More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2600 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
134 aa  277  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  76.19 
 
 
127 aa  205  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  78.57 
 
 
152 aa  204  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4160  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.61 
 
 
151 aa  200  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  70.87 
 
 
127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1233  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.22 
 
 
127 aa  194  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0668602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  66.93 
 
 
128 aa  190  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0012737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  65.87 
 
 
127 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
127 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
127 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
127 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.87 
 
 
127 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.29 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2213  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.29 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3532  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.08 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2155  glyoxalase family protein  65.08 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.29 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  64.8 
 
 
129 aa  167  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  60.8 
 
 
128 aa  165  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.79 
 
 
128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  60 
 
 
128 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  60 
 
 
128 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  60.98 
 
 
136 aa  164  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.49 
 
 
127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  60.98 
 
 
128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  60.32 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  60.98 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  59.2 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.2 
 
 
129 aa  159  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
128 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  60 
 
 
130 aa  159  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.11 
 
 
129 aa  158  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3386  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.8 
 
 
129 aa  158  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27488  normal  0.335444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  60.16 
 
 
128 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.32 
 
 
128 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2496  glyoxylase I family protein  65.87 
 
 
127 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.7 
 
 
128 aa  157  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  61.11 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  60.32 
 
 
129 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  61.11 
 
 
129 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.32 
 
 
129 aa  154  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2315  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.16 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00458  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.73 
 
 
128 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1030  glyoxalase family protein  60.47 
 
 
132 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.8 
 
 
133 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1083  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.47 
 
 
132 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3418  hypothetical protein  60.47 
 
 
132 aa  152  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  60.32 
 
 
129 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  57.94 
 
 
129 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  57.94 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  57.94 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  57.94 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  57.94 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.94 
 
 
129 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 
129 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.57 
 
 
134 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.2 
 
 
129 aa  136  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.4 
 
 
129 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3343  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.4 
 
 
129 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  50.4 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  50.38 
 
 
131 aa  129  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0663  glyoxylase family protein  59.41 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35908e-32 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0962  glyoxylase family protein  53.68 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.023462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0667  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.52 
 
 
138 aa  123  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0382094  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01792  glyoxylase I family protein  62.26 
 
 
55 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1275  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.82 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2816  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 
318 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2464  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.88 
 
 
196 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5200  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dihydroxybiphenyl dioxygenase  32.39 
 
 
201 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000172312  normal  0.0747764 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1423  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0328  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
314 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.37 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.72 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1860  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.26 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.614364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.81 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1140  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
200 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4638  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.47 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.01 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2304  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 
193 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5628  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
172 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615046  normal  0.490927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6311  hypothetical protein  32.03 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5249  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
172 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2053  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.573082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5337  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
172 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0971  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.09 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380458  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  30.37 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.94 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>