120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2574 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1910  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.976788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2574  transposase and inactivated derivative  100 
 
 		 177 aa  361  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0224006  decreased coverage  0.000135385 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5570  transposase and inactivated derivative  90.91 
 
 		 177 aa  299  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1806  transposase and inactivated derivative  88.79 
 
 		 123 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.731947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  33.77 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  33.11 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  33.11 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  33.11 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  33.11 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  33.11 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00177  transposase  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00185  transposase  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00187  transposase  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00189  transposase  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00191  transposase  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00318  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00320  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00322  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00369  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00371  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00476  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01018  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01035  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02170  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03714  hypothetical protein  32.26 
 
 		 162 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0264996  normal  0.0590774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2275  ISSod10, transposase OrfA  30.41 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2874  ISSod10, transposase OrfA  30.41 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4533  ISSod10, transposase OrfA  30.41 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0244  ISSod10, transposase OrfA  31.25 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3812  ISSod10, transposase OrfA  31.25 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0211  ISSod10, transposase OrfA  30.88 
 
 		 146 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1558  ISSod10, transposase OrfA  30.87 
 
 		 159 aa  84.3  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0130  ISSod10, transposase OrfA  30.87 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0420595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0673  ISSod10, transposase OrfA  30.87 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000190511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0675  ISSod10, transposase OrfA  30.87 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3795  ISSod10, transposase OrfA  30.87 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000216362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3793  ISSod10, transposase OrfA  30.87 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.97835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2376  transposase and inactivated derivative  29.23 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.91006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2222  transposase and inactivated derivative  31.06 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000163845  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2009  transposase and inactivated derivative  30.58 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.639422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4210  hypothetical protein  31.82 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1553  ISSod10, transposase OrfA  32.17 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3160  hypothetical protein  28.83 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3924  ISSod10, transposase OrfA  24.79 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4045  ISSod10, transposase OrfA  24.79 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6884  hypothetical protein  32.93 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0848  ISSod10, transposase OrfA  32.1 
 
 		 94 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8620  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1831  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.759807 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2042  transposase and inactivated derivative  28.29 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0921  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000501213 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  29.75 
 
 		 356 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3696  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0149  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4323  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2030  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2425  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3464  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.27 
 
 		 350 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  29.92 
 
 		 356 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  29.92 
 
 		 356 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  29.92 
 
 		 356 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1715  hypothetical protein  31.34 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3919  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 349 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.876947  normal  0.636395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1894  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3719  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2238  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1833  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3552  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3281  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1450  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2897  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3928  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021462  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2505  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11687  normal  0.0450356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4058  transposase and inactivated derivative  27.63 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.407481  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0801  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1138  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1412  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1933  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1965  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  48.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8431  hypothetical protein  30.67 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2908  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.01 
 
 		 350 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.773873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 355 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 355 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 355 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3545  putative integrase protein  27.34 
 
 		 345 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3780  putative integrase protein  27.34 
 
 		 345 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2869  hypothetical protein  24.46 
 
 		 351 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0667  putative integrase protein  27.34 
 
 		 345 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  31.3 
 
 		 311 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0088  putative transposase  28.97 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.984719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3114  transposase  27.66 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0282  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0884  transposon protein  30.84 
 
 		 136 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1462  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1659  hypothetical protein  30.84 
 
 		 136 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0595938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3129  transposase of IS653-like element  22.01 
 
 		 187 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>