More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2547 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2714  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.42 
 
 
459 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
458 aa  922    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2851  histidine kinase  62.69 
 
 
500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.3 
 
 
501 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2501  histidine kinase  63.3 
 
 
501 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  62.25 
 
 
471 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1583  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.95 
 
 
505 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0815903  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4362  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.71 
 
 
509 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.41 
 
 
474 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.623691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1573  putative oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  57.01 
 
 
434 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1894  histidine kinase  51.47 
 
 
471 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0479288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
453 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1878  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
449 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0696296  normal  0.299765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2308  putative oxidative stress resistance periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 
449 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.237134  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  42.92 
 
 
453 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  41.37 
 
 
445 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  43.13 
 
 
453 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
453 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2508  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2396  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
445 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1486  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
452 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1981  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
445 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0389833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3324  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
445 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000798172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6140  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
453 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0713487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2353  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
445 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0151579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1254  sensor histidine kinase RisS  41.07 
 
 
452 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00703057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
453 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1939  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
453 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 
453 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1002  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
449 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101119  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1963  histidine kinase  41.63 
 
 
453 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.0478368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5250  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00425719  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  42.56 
 
 
449 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
449 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  38.53 
 
 
433 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  34.77 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  34.06 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  30.39 
 
 
430 aa  170  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  35.76 
 
 
446 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  30.88 
 
 
438 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  35.86 
 
 
436 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  34.54 
 
 
436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  31.19 
 
 
438 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  36.27 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  31.05 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  31.19 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  32.77 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  31.19 
 
 
438 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  32.67 
 
 
438 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  35.42 
 
 
437 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.42 
 
 
437 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.42 
 
 
437 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  35.42 
 
 
437 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
437 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
437 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
437 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  32.86 
 
 
440 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  29.57 
 
 
432 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
440 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  28.31 
 
 
429 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.76 
 
 
444 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  32.58 
 
 
438 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  32.58 
 
 
429 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
438 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  32.58 
 
 
438 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  33.77 
 
 
436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
472 aa  153  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
438 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  33.63 
 
 
437 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
438 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
437 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  36.62 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00170031  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  32.08 
 
 
437 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
443 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  31.18 
 
 
439 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  28.07 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  28.07 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  28.07 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  28.07 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  34.19 
 
 
450 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  28.07 
 
 
450 aa  146  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  31.3 
 
 
523 aa  146  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  28.07 
 
 
450 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  34.19 
 
 
450 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
437 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
437 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  30.9 
 
 
439 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  35.9 
 
 
450 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  35.9 
 
 
450 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  34.63 
 
 
438 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
486 aa  144  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
421 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  28.75 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6461  histidine kinase  32.98 
 
 
425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949538  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>