More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2467 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2467  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
269 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3281  IstB ATP binding domain-containing protein  61.71 
 
 
262 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4884  IstB-like ATP-binding protein  63.64 
 
 
253 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2089  IstB domain protein ATP-binding protein  63.89 
 
 
252 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3158  IstB domain protein ATP-binding protein  63.89 
 
 
252 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0316  IstB domain protein ATP-binding protein  63.49 
 
 
252 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0009  IstB domain protein ATP-binding protein  63.89 
 
 
252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2910  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1588  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4854  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.640312  hitchhiker  0.00176569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4857  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0232299  hitchhiker  0.00902527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1051  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1096  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2873  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6479  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2938  IstB domain protein ATP-binding protein  54.29 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333111  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1064  IstB domain protein ATP-binding protein  52.73 
 
 
262 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1129  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
262 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1071  IstB domain protein ATP-binding protein  54.29 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0944  IstB domain protein ATP-binding protein  52.34 
 
 
262 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1140  IstB domain protein ATP-binding protein  49.8 
 
 
257 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241939  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  38.28 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  36.1 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  36.1 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  36.1 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  36.24 
 
 
259 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  39.41 
 
 
266 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  39.11 
 
 
257 aa  158  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  35.68 
 
 
259 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  33.74 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  33.74 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  33.74 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  33.74 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  35.66 
 
 
285 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  35.66 
 
 
285 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  35.12 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  35.12 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  38.22 
 
 
265 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  38.74 
 
 
264 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  32.31 
 
 
252 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  35.55 
 
 
258 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  35.55 
 
 
258 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  36 
 
 
285 aa  148  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
252 aa  149  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  35.96 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  35.96 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  32.3 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  40 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  40 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  40 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  40 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  40 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  40 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0357  transposase/IS protein  35.35 
 
 
262 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  35.14 
 
 
273 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  35.47 
 
 
254 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0018  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0056  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0193  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0291  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0832  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0864  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2322  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000340663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2388  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0695654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2741  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3014  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3225  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3432  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0345153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3607  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.525084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4014  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4270  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4626  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4729  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4768  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5576  ISPsy4, transposition helper protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  35.34 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1555  IstB domain protein ATP-binding protein  38.39 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0506  IstB domain protein ATP-binding protein  38.39 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1508  IstB domain protein ATP-binding protein  38.39 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.305327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  31.98 
 
 
266 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  31.98 
 
 
266 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  31.98 
 
 
266 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>