81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2389 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 599 aa  1207    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  56.67 
 
 		 606 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  56.85 
 
 		 606 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.36 
 
 		 615 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  55.09 
 
 		 618 aa  629  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  60.59 
 
 		 506 aa  601  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.11 
 
 		 585 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.47 
 
 		 663 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.03 
 
 		 683 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.61 
 
 		 683 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.67 
 
 		 684 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.45 
 
 		 683 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.3 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  23.72 
 
 		 627 aa  100  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.68 
 
 		 619 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.73 
 
 		 659 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.27 
 
 		 665 aa  97.8  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.32 
 
 		 613 aa  95.9  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.04 
 
 		 627 aa  94.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.89 
 
 		 612 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  21.47 
 
 		 610 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  22.35 
 
 		 615 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  25.2 
 
 		 592 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.86 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.76 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  21.06 
 
 		 484 aa  70.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.38 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  32.24 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.65 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  22.96 
 
 		 634 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.26 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.49 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  21.17 
 
 		 576 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.75 
 
 		 398 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.39 
 
 		 581 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.83 
 
 		 581 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.17 
 
 		 361 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.88 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  26.32 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.73 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.45 
 
 		 874 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  31.73 
 
 		 490 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  44.07 
 
 		 452 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.16 
 
 		 852 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  31.25 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.44 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.81 
 
 		 378 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  33.66 
 
 		 840 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.7 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  30.47 
 
 		 858 aa  51.6  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  20.53 
 
 		 575 aa  50.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  27.54 
 
 		 885 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  20.33 
 
 		 570 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 375 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  25.56 
 
 		 388 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  32 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.67 
 
 		 559 aa  48.9  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.01 
 
 		 580 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  36.84 
 
 		 275 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  30.83 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.14 
 
 		 577 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  28.76 
 
 		 274 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  29.41 
 
 		 274 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  22.56 
 
 		 906 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.97 
 
 		 845 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  36.63 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  24 
 
 		 384 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.13 
 
 		 432 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  36.63 
 
 		 293 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  22.04 
 
 		 816 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  32.39 
 
 		 275 aa  44.3  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.29 
 
 		 405 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  28.43 
 
 		 429 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>