26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2337 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  320  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  66.46 
 
 
162 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  62.03 
 
 
163 aa  220  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  63.92 
 
 
162 aa  219  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  65.19 
 
 
162 aa  217  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  60.76 
 
 
162 aa  210  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  60.13 
 
 
174 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  47.55 
 
 
167 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  41.1 
 
 
302 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  41.1 
 
 
155 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  42.47 
 
 
302 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  41.1 
 
 
301 aa  119  2e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  46.9 
 
 
152 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  42.47 
 
 
301 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  43.62 
 
 
170 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  41.55 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  36.18 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  31.25 
 
 
178 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  30.71 
 
 
174 aa  49.7  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  30.22 
 
 
174 aa  49.7  1e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  28.26 
 
 
175 aa  48.9  3e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  28.78 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  26.03 
 
 
286 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  36.36 
 
 
153 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  27.03 
 
 
272 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  32.84 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>