73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2323 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  100 
 
 
136 aa  273  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  83.58 
 
 
137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  76.47 
 
 
141 aa  206  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  72.18 
 
 
138 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  72.18 
 
 
138 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  70.99 
 
 
131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  69.47 
 
 
131 aa  197  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  69.92 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  71.11 
 
 
138 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  67.42 
 
 
133 aa  191  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  65.15 
 
 
135 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  63.64 
 
 
132 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  61.36 
 
 
155 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  66.42 
 
 
134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  59.85 
 
 
132 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  54.48 
 
 
136 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  52.71 
 
 
138 aa  144  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50.37 
 
 
134 aa  139  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  49.26 
 
 
137 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  47.79 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  47.79 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.43 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  48.87 
 
 
139 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  42.75 
 
 
164 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.09 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  46.62 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  52.94 
 
 
148 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  45.67 
 
 
128 aa  119  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  43.88 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  41.13 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  45.31 
 
 
132 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  42.75 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  42.75 
 
 
129 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  47.06 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  44.62 
 
 
128 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  41.13 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  37.14 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  42.4 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  44.72 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  44.35 
 
 
133 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  41.6 
 
 
158 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  40.74 
 
 
157 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  39.69 
 
 
158 aa  105  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.95 
 
 
168 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  40.83 
 
 
137 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  37.78 
 
 
243 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.82 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  36.15 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.11 
 
 
242 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.06 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.17 
 
 
243 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.33 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  36 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.86 
 
 
247 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.15 
 
 
227 aa  77  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.8 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.5 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  27.87 
 
 
247 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  27.66 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  25.52 
 
 
182 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.71 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  30.63 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.93 
 
 
519 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  34.48 
 
 
520 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  35.23 
 
 
527 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.71 
 
 
522 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.33 
 
 
520 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  33.7 
 
 
495 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.97 
 
 
499 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  32.97 
 
 
522 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30 
 
 
482 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  30.97 
 
 
518 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>