36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2322 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  350  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  80.24 
 
 		 165 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  60.95 
 
 		 159 aa  223  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  66.45 
 
 		 155 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  65.58 
 
 		 152 aa  217  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  66.19 
 
 		 156 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  64.58 
 
 		 154 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  60.13 
 
 		 155 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  65.96 
 
 		 155 aa  206  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  65.96 
 
 		 155 aa  206  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  62.34 
 
 		 154 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  57.14 
 
 		 156 aa  204  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  63.12 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  61.84 
 
 		 156 aa  200  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  57.82 
 
 		 157 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  55.69 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  59.29 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  54.93 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  50.62 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  50.62 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  49.38 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  45 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  44.37 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  41.78 
 
 		 149 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  39.73 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  38.41 
 
 		 158 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  39.13 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  35.33 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  38.41 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  41.43 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  38.26 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  36.71 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  35.76 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  36.23 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  38.85 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  30.37 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>