More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2298 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  82.55 
 
 		 154 aa  248  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  52.74 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  50.66 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  51.97 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  47.62 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  46.21 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  45.52 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  47.02 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  42.58 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  38.41 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  42.28 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  38.31 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  36.31 
 
 		 151 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  36.31 
 
 		 151 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  34.64 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  36.31 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.87 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  45.64 
 
 		 141 aa  88.2  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.62 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  37.24 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  37.58 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36.42 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  39.47 
 
 		 151 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.76 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  37.84 
 
 		 148 aa  85.5  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  35.1 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  34.67 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  36.24 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  37.18 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  38.67 
 
 		 144 aa  84.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  37.84 
 
 		 145 aa  84.3  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  41.03 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  38.41 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 152 aa  84  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  38.61 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  35.29 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  38.06 
 
 		 415 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.72 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  39.07 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  38.61 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.96 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  34.64 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.96 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  39.74 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  37.97 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.56 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4708  hypothetical protein  38.41 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  36.42 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  39.46 
 
 		 304 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  40.27 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  39.74 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  37.97 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  37.97 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  37.84 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  37.97 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.08 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  37.97 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.56 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.06 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.96 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  41.06 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  34.44 
 
 		 288 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  37.34 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  35.14 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>