191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2296 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  82.27 
 
 
248 aa  370  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  68.49 
 
 
227 aa  288  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  64.71 
 
 
232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  62.79 
 
 
212 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  63.43 
 
 
220 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0633  DSBA oxidoreductase  63.43 
 
 
220 aa  275  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  61.36 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  58.18 
 
 
220 aa  269  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  58.26 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  57.34 
 
 
215 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  59.36 
 
 
222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  61.01 
 
 
228 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  58.14 
 
 
213 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  52.73 
 
 
221 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
221 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  55.45 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  50.45 
 
 
221 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  50 
 
 
217 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  48.42 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1642  DSBA oxidoreductase  48.86 
 
 
218 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.420211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5788  DSBA oxidoreductase  49.54 
 
 
215 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1605  DSBA oxidoreductase  45.45 
 
 
215 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  44.19 
 
 
222 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 
217 aa  184  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  40.64 
 
 
216 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  43.14 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  44.65 
 
 
216 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0728  DSBA oxidoreductase  42.6 
 
 
230 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.12 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 
213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  39.09 
 
 
215 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  38.89 
 
 
223 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  37.96 
 
 
217 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  35.78 
 
 
214 aa  148  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  35.91 
 
 
224 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 
222 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  39.07 
 
 
236 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 
221 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  34.1 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  34.1 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  33.48 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
214 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  33.03 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  33.95 
 
 
223 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  34.72 
 
 
243 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.72 
 
 
243 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
221 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  30.7 
 
 
227 aa  121  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
235 aa  121  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  34.26 
 
 
243 aa  121  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  36.74 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  34.26 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  34.26 
 
 
243 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 
235 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  34.26 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
208 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
215 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0979  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
215 aa  115  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00033798  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  35.94 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  32.44 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
213 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22650  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  33.8 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.483834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  35.51 
 
 
233 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  32.59 
 
 
221 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 
244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.62 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 
209 aa  108  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  34.26 
 
 
222 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
243 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  31.7 
 
 
212 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
235 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
243 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
243 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 
209 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1893  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
238 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
247 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 
244 aa  104  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
234 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 
218 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
270 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>