More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2283 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  100 
 
 		 331 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  49.54 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  49.54 
 
 		 331 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.42 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  33.33 
 
 		 400 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1909  integrase family protein  27.24 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838759  hitchhiker  0.00000212902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.34 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  32.02 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  31.05 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  30.4 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  36 
 
 		 429 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  30.58 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  33.02 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  33.77 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.08 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  33.33 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.56 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.89 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  27.18 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  26.55 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  26.76 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  28.75 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.41 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  33.17 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.56 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  30.09 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  30.72 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  30.09 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  29.07 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.2 
 
 		 172 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  28.92 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  28.4 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  31.32 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  35.66 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  26.05 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.69 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  31.32 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  35.07 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  29.63 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.64 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.83 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.73 
 
 		 251 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  23.23 
 
 		 372 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  29.63 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  26.25 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  29.51 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  26.19 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  26.33 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  28.02 
 
 		 378 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  28.28 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  25.75 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  26.19 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.71 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  41.77 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  32.48 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  25.87 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  27.59 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  28.4 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  47.62 
 
 		 99 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  26.3 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.9 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  27.2 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.14 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.08 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  24.08 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  32.03 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  27.88 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.33 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  27.86 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.7 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.13 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  25.24 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  29.86 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.03 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  28.4 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.33 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  28.81 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  32.89 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  40.68 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  32.52 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  23.14 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  26.67 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  27.1 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.2 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>