More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2213 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  61.03 
 
 		 564 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  89.95 
 
 		 570 aa  1058    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 580 aa  1188    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  78.27 
 
 		 572 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  57.3 
 
 		 575 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  57.89 
 
 		 581 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  58.02 
 
 		 575 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  53.85 
 
 		 564 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  53.13 
 
 		 561 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  51.98 
 
 		 568 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  51.17 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  51.53 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  50.71 
 
 		 574 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  51.34 
 
 		 549 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  50.44 
 
 		 572 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  51.35 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  51.18 
 
 		 567 aa  528  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  50.09 
 
 		 576 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.62 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  48.57 
 
 		 570 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  50.82 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  49.19 
 
 		 548 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  50.82 
 
 		 567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  50.27 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  50.09 
 
 		 567 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  50.27 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  50.82 
 
 		 567 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  49.01 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  48.75 
 
 		 564 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 		 567 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  49.55 
 
 		 567 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  48.31 
 
 		 565 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  48.76 
 
 		 572 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  48.65 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  47.76 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  48.13 
 
 		 558 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  48.65 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  48.72 
 
 		 553 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  47.95 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  47.02 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  48.4 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  46.45 
 
 		 567 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  47.51 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  47.51 
 
 		 552 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 582 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  46.05 
 
 		 559 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  48.4 
 
 		 558 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  47.83 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  48.65 
 
 		 556 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.44 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  45.23 
 
 		 559 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  48.31 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  47.35 
 
 		 558 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  44.78 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  41.45 
 
 		 568 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  43.21 
 
 		 538 aa  415  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.04 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  40.72 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40.18 
 
 		 583 aa  360  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  40.14 
 
 		 543 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  36.95 
 
 		 561 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.25 
 
 		 560 aa  316  9e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.81 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.56 
 
 		 543 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  39.4 
 
 		 587 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  37.85 
 
 		 586 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.03 
 
 		 552 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.64 
 
 		 562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  31.51 
 
 		 545 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.89 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  31.32 
 
 		 555 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.92 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.26 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.04 
 
 		 573 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.56 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.3 
 
 		 588 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.91 
 
 		 548 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.73 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.35 
 
 		 548 aa  236  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  28.77 
 
 		 574 aa  236  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.78 
 
 		 548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.22 
 
 		 573 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.35 
 
 		 548 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.78 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.46 
 
 		 561 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.35 
 
 		 548 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  30.7 
 
 		 560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.35 
 
 		 548 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.59 
 
 		 548 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.6 
 
 		 548 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.17 
 
 		 548 aa  233  6e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  30.35 
 
 		 548 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>