More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2163 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  92.19 
 
 		 284 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  89.18 
 
 		 281 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0068  precorrin-4 C11-methyltransferase  75.09 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.85 
 
 		 273 aa  359  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  71.88 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0438  cobalt-precorrin-4 methyltransferase  79.92 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  79.92 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1693  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.68 
 
 		 269 aa  348  6e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  68.11 
 
 		 272 aa  328  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  62.5 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.81 
 
 		 248 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.09 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.63 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.31 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.73 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.03 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.34 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.86 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  45.31 
 
 		 257 aa  212  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.53 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.82 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.04 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.21 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.14 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.96 
 
 		 254 aa  205  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.82 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.34 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 		 257 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 		 251 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.29 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.75 
 
 		 267 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.9 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.26 
 
 		 867 aa  198  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.35 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.27 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.6 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.08 
 
 		 626 aa  196  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.84 
 
 		 610 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.37 
 
 		 244 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.37 
 
 		 253 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.14 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.98 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.16 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  41.5 
 
 		 614 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.46 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.7 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.44 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.8 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1718  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.02 
 
 		 598 aa  185  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.956767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  42.46 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  42.06 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.02 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2635  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.231618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1968  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.58 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3154  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.48 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.134288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.09 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.48 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3260  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.71 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2357  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.47 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0176  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.32 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0121511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.11 
 
 		 626 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2394  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.39 
 
 		 242 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1955  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2117  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1972  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.71 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2821  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.85 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1475  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.47 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1157  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0901  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324814  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.38 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1598  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0259  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1525  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.38 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.466887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3020  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.89 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.98 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  40.87 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.89 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4589  precorrin-4 C11-methyltransferase  38.89 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  37.7 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3152  precorrin-4 C11-methyltransferase  39.92 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.422575  normal  0.404272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3184  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.41 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1980  precorrin-4 C11-methyltransferase  41.18 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>