More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2067 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
324 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  62.58 
 
 
328 aa  361  9e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  61.94 
 
 
330 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  61.94 
 
 
330 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  62.26 
 
 
330 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  62.26 
 
 
330 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  61.94 
 
 
330 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  61.59 
 
 
329 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  61.59 
 
 
329 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  61.59 
 
 
329 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  60.95 
 
 
329 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  60.95 
 
 
329 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  59.68 
 
 
330 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  58.75 
 
 
327 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  57.76 
 
 
320 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  57.51 
 
 
327 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  60 
 
 
316 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  59.42 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  59.68 
 
 
316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  55.7 
 
 
312 aa  329  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  57.86 
 
 
329 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  57.78 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  58.33 
 
 
316 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  55.77 
 
 
345 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  56.73 
 
 
314 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  57.37 
 
 
316 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  57.23 
 
 
316 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  54.6 
 
 
319 aa  322  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  59.31 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  58.14 
 
 
306 aa  315  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  54.84 
 
 
315 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  53 
 
 
317 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  49.03 
 
 
319 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  52.56 
 
 
340 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.44 
 
 
320 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.88 
 
 
320 aa  242  5e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  37.58 
 
 
313 aa  224  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.82 
 
 
270 aa  223  4e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.99 
 
 
317 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  39.56 
 
 
329 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  40.57 
 
 
320 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  36.53 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  40.46 
 
 
301 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  39.63 
 
 
344 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  37.77 
 
 
315 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  38.16 
 
 
301 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  35.22 
 
 
314 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  38.34 
 
 
319 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40.43 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  37.59 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.57 
 
 
313 aa  136  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.82 
 
 
308 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  37.09 
 
 
311 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  39.17 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  35.25 
 
 
308 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  35.25 
 
 
308 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  36.52 
 
 
308 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  36.52 
 
 
308 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  36.94 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  36.17 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  38.77 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  39.49 
 
 
308 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  36.07 
 
 
339 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  39.49 
 
 
308 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  39.49 
 
 
308 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  37.23 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  40.62 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 
308 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  37.67 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  35.61 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.58 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  35.97 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  39.13 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  39.13 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  39.13 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  39.13 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  32.34 
 
 
323 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  36.12 
 
 
320 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.99 
 
 
311 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  30.25 
 
 
312 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  35.84 
 
 
309 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  39.08 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  36.23 
 
 
309 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.22 
 
 
308 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  34.16 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.77 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.82 
 
 
311 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.44 
 
 
291 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  33.57 
 
 
315 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  33.45 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  33.45 
 
 
315 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  33.57 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.06 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.33 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.06 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  33.45 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  33.45 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.78 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>