More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2061 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  64.31 
 
 		 839 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  60.16 
 
 		 846 aa  874    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  64.31 
 
 		 839 aa  896    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  65.48 
 
 		 821 aa  932    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  60.33 
 
 		 698 aa  831    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  65.81 
 
 		 850 aa  964    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  64.31 
 
 		 928 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  64.57 
 
 		 844 aa  891    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  61.24 
 
 		 743 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 810 aa  1651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  60.81 
 
 		 742 aa  854    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  64.13 
 
 		 862 aa  898    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  64.31 
 
 		 844 aa  895    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  65.43 
 
 		 857 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  61.1 
 
 		 841 aa  853    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  64.31 
 
 		 844 aa  895    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  65.05 
 
 		 787 aa  881    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  61.83 
 
 		 787 aa  846    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  65.38 
 
 		 888 aa  879    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  61.13 
 
 		 732 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  61.87 
 
 		 686 aa  843    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  63.24 
 
 		 678 aa  831    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  62.89 
 
 		 675 aa  853    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  73.49 
 
 		 801 aa  1019    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  65.44 
 
 		 838 aa  921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.88 
 
 		 834 aa  907    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  66.05 
 
 		 826 aa  950    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  64.31 
 
 		 844 aa  895    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  61.53 
 
 		 743 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  64.02 
 
 		 857 aa  885    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  64.13 
 
 		 858 aa  898    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  59.76 
 
 		 846 aa  872    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  66.31 
 
 		 846 aa  885    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  65.28 
 
 		 870 aa  909    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  61.49 
 
 		 728 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  64.02 
 
 		 857 aa  885    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  61.53 
 
 		 743 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  50.46 
 
 		 783 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  39.42 
 
 		 743 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.54 
 
 		 750 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 774 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.43 
 
 		 850 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.69 
 
 		 740 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  38.62 
 
 		 730 aa  427  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.73 
 
 		 815 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  39.16 
 
 		 755 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  38.91 
 
 		 760 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.3 
 
 		 794 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.54 
 
 		 762 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  33.69 
 
 		 762 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  35.22 
 
 		 854 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.2 
 
 		 786 aa  411  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.28 
 
 		 752 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  35.53 
 
 		 759 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.07 
 
 		 772 aa  402  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.95 
 
 		 785 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.16 
 
 		 786 aa  393  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.5 
 
 		 907 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  34.72 
 
 		 765 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.22 
 
 		 767 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 		 768 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.47 
 
 		 773 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.12 
 
 		 776 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.01 
 
 		 809 aa  320  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.36 
 
 		 648 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  31.1 
 
 		 819 aa  310  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  31.24 
 
 		 819 aa  309  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  30.23 
 
 		 819 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  30.65 
 
 		 818 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  29.89 
 
 		 823 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 		 804 aa  300  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.84 
 
 		 646 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 681 aa  300  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 		 831 aa  297  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  32.25 
 
 		 648 aa  296  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.65 
 
 		 683 aa  296  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  29.8 
 
 		 830 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.96 
 
 		 795 aa  293  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  30.03 
 
 		 830 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  29.66 
 
 		 835 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 810 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  30.64 
 
 		 843 aa  292  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  31.85 
 
 		 778 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  30.06 
 
 		 804 aa  287  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  29.21 
 
 		 777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  31.91 
 
 		 790 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.43 
 
 		 649 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.12 
 
 		 748 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  32.76 
 
 		 679 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  29.56 
 
 		 833 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  31.95 
 
 		 791 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  30.63 
 
 		 771 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  30.38 
 
 		 817 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  32.78 
 
 		 824 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 824 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  31.11 
 
 		 713 aa  278  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  29.38 
 
 		 823 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.95 
 
 		 796 aa  277  6e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 		 817 aa  277  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  30.52 
 
 		 830 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>