260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1977 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  78.29 
 
 
267 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  78.21 
 
 
268 aa  424  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  79.22 
 
 
272 aa  416  1e-115  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  77.25 
 
 
268 aa  417  1e-115  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  79.22 
 
 
272 aa  416  1e-115  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  70.83 
 
 
266 aa  399  1e-110  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  73.62 
 
 
266 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  72.27 
 
 
268 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  72.83 
 
 
268 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  71.88 
 
 
267 aa  388  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  69.8 
 
 
269 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  69.53 
 
 
267 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  67.68 
 
 
267 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  71.26 
 
 
271 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  71.48 
 
 
272 aa  378  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  69.29 
 
 
267 aa  377  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  67.68 
 
 
267 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  67.32 
 
 
267 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  68.36 
 
 
267 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  67.72 
 
 
267 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  68.36 
 
 
267 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  69.69 
 
 
268 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  67.32 
 
 
307 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  66.93 
 
 
278 aa  364  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.5 
 
 
286 aa  354  7e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  64.96 
 
 
272 aa  351  8e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  62.12 
 
 
285 aa  348  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  63.81 
 
 
286 aa  348  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  62.5 
 
 
279 aa  337  1e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  61.72 
 
 
271 aa  329  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  2.22341e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  61.07 
 
 
265 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  61.72 
 
 
276 aa  328  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  61.02 
 
 
270 aa  327  9e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  62.99 
 
 
266 aa  326  2e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  62.35 
 
 
271 aa  324  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  64 
 
 
279 aa  319  2e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  59.45 
 
 
280 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  58.69 
 
 
275 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  58.59 
 
 
268 aa  315  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  62.81 
 
 
277 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  59.06 
 
 
260 aa  314  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  58.37 
 
 
260 aa  312  4e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  58.02 
 
 
270 aa  311  7e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  57.03 
 
 
267 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  58.87 
 
 
260 aa  308  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  53.05 
 
 
280 aa  307  1e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.03 
 
 
267 aa  307  1e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  58.82 
 
 
273 aa  306  2e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  55.09 
 
 
265 aa  304  9e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  60.31 
 
 
270 aa  304  1e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  56.15 
 
 
272 aa  304  1e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  57.25 
 
 
269 aa  304  1e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  60.67 
 
 
260 aa  303  2e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  54.72 
 
 
265 aa  303  2e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  57.09 
 
 
270 aa  303  2e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  54.72 
 
 
265 aa  303  2e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  56.3 
 
 
270 aa  302  4e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  56.69 
 
 
270 aa  302  5e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  60.25 
 
 
260 aa  301  8e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  56.25 
 
 
270 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.03 
 
 
266 aa  299  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.02 
 
 
270 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  57.42 
 
 
282 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  57.42 
 
 
282 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.25 
 
 
271 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  57.42 
 
 
282 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  57.25 
 
 
283 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  57.25 
 
 
283 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  57.25 
 
 
283 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  56.25 
 
 
284 aa  294  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  56.86 
 
 
282 aa  292  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  51.56 
 
 
285 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  55.69 
 
 
273 aa  289  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  56.69 
 
 
270 aa  279  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  48.77 
 
 
266 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  47.95 
 
 
267 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.95 
 
 
267 aa  219  4e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.95 
 
 
267 aa  219  4e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  47.54 
 
 
267 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.46 
 
 
308 aa  111  1e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  27.54 
 
 
263 aa  96.3  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.32 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.54 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.32 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  28.29 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  28.42 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  32.56 
 
 
4917 aa  84  2e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  28.57 
 
 
324 aa  81.6  1e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  28.46 
 
 
321 aa  80.5  2e-14  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  29.53 
 
 
4979 aa  80.1  3e-14  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  28.23 
 
 
317 aa  79  7e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.39 
 
 
290 aa  79  9e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.22684e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  27.5 
 
 
297 aa  78.2  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2836  gas vesicle protein GvpN  26.87 
 
 
340 aa  77.8  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  25.76 
 
 
297 aa  76.6  3e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 
291 aa  77  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  30 
 
 
4844 aa  77  3e-13  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  25.76 
 
 
297 aa  76.6  4e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  25.76 
 
 
297 aa  76.6  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.70492e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>