43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1829 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  63.75 
 
 
258 aa  301  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  62.66 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  60.85 
 
 
243 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  61.57 
 
 
256 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  61 
 
 
256 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  51.88 
 
 
258 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  37.39 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  34.85 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  36.25 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  34.45 
 
 
328 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  32.37 
 
 
329 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  31.78 
 
 
241 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  33.2 
 
 
335 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  32.38 
 
 
329 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  35.54 
 
 
365 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  29.05 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  32.81 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  34.08 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  30.08 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  33.19 
 
 
339 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  31.85 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  29.63 
 
 
246 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  29.54 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  32.79 
 
 
334 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  33.74 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  29.96 
 
 
229 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  34.14 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  33.74 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  26.91 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  23.08 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  25.83 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  22.31 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  23.97 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  28.41 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.2 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  27.64 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25.66 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  26.48 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  25.32 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  25.38 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  23.83 
 
 
264 aa  55.5  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  26.69 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>