30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1828 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1067    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  54.16 
 
 
528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  54.93 
 
 
527 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  53.89 
 
 
528 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  46.95 
 
 
527 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  29.78 
 
 
426 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  33.56 
 
 
422 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  32.87 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  32.29 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  32.08 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  32.08 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  29.54 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  33.12 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  27.37 
 
 
402 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0393  secretory lipase  34.69 
 
 
386 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0474  secretory lipase  34.01 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  28.7 
 
 
404 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  33.33 
 
 
412 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  28.8 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2597  secretory lipase  30.94 
 
 
405 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0910  secretory lipase  31.65 
 
 
346 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.307152 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  28.48 
 
 
417 aa  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  28.52 
 
 
465 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  32.81 
 
 
376 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2000  secretory lipase  26.15 
 
 
385 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.524449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  30.77 
 
 
427 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  31.82 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  29.93 
 
 
427 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3563  secretory lipase  29.49 
 
 
383 aa  44.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.668389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>