172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1755 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  73.65 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  60.84 
 
 		 166 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  59.28 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  59.28 
 
 		 162 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  61.08 
 
 		 167 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  56.1 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  54.88 
 
 		 158 aa  171  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  56.36 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  55.09 
 
 		 158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  52.44 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  53.66 
 
 		 161 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  52.44 
 
 		 161 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  51.5 
 
 		 156 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  50.9 
 
 		 156 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  50.9 
 
 		 156 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  46.75 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  50.9 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  50.9 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  46.11 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  50.61 
 
 		 153 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  45.18 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  45.51 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  49.7 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  49.7 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  43.98 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  46.95 
 
 		 145 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  46.95 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  42.77 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  42.77 
 
 		 149 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  42.77 
 
 		 149 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  44.85 
 
 		 148 aa  131  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.9 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  42.17 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  42.17 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  42.17 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  42.17 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  42.17 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  42.17 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  46.71 
 
 		 156 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  46.71 
 
 		 156 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  46.71 
 
 		 156 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  47.31 
 
 		 156 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  43.03 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  45.73 
 
 		 154 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  41.82 
 
 		 146 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  39.64 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  38.79 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  38.79 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  39.39 
 
 		 146 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  37.95 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  41.21 
 
 		 146 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  38.18 
 
 		 143 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  38.73 
 
 		 157 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  56.86 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  27.84 
 
 		 546 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 511 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 		 511 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 503 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 1910 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  46 
 
 		 404 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1487  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  46 
 
 		 404 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 439 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  48.08 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 546 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  44.64 
 
 		 651 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 339 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 451 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 572 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 322 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 374 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  34.52 
 
 		 378 aa  51.6  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  42.37 
 
 		 256 aa  51.2  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 382 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 1079 aa  51.2  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  50 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1486  peptidoglycan-binding LysM  39.62 
 
 		 351 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 680 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 360 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 362 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  36.67 
 
 		 403 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  34.52 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  34.52 
 
 		 374 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  41.94 
 
 		 663 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  35.21 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  36.9 
 
 		 365 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  35.94 
 
 		 380 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  38.89 
 
 		 405 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  38.03 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  38.18 
 
 		 1082 aa  48.5  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>