More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1732 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  72.2 
 
 
274 aa  288  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  77.37 
 
 
261 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  83.46 
 
 
221 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  77.95 
 
 
233 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  77.87 
 
 
274 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  81.67 
 
 
263 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  77.87 
 
 
262 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  77.19 
 
 
189 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  73.6 
 
 
261 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  60 
 
 
256 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  58.28 
 
 
241 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  75 
 
 
250 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  68.64 
 
 
152 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  64.8 
 
 
203 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  67.83 
 
 
154 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  64 
 
 
205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  64 
 
 
213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  67.54 
 
 
146 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  67.54 
 
 
146 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  67.54 
 
 
148 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  63.64 
 
 
154 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  63.64 
 
 
151 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  66.67 
 
 
147 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  66.67 
 
 
147 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  66.67 
 
 
147 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  65.79 
 
 
149 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  54.47 
 
 
129 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  52 
 
 
130 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  49.53 
 
 
121 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  53.06 
 
 
117 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  48.6 
 
 
115 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  47 
 
 
158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  46.67 
 
 
119 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  46 
 
 
115 aa  105  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.07 
 
 
116 aa  98.6  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  40.95 
 
 
123 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  36.63 
 
 
210 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  34.58 
 
 
150 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  40.38 
 
 
123 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  37.04 
 
 
128 aa  92.8  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  38.24 
 
 
166 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  37.62 
 
 
135 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  36.13 
 
 
156 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  36.7 
 
 
123 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  39.42 
 
 
114 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  41.58 
 
 
118 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  38.24 
 
 
137 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.58 
 
 
118 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  41.58 
 
 
140 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  39.6 
 
 
130 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  36.84 
 
 
150 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  45.05 
 
 
139 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  45.05 
 
 
139 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  34.29 
 
 
143 aa  89.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  45.05 
 
 
158 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  37.36 
 
 
147 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  35.79 
 
 
149 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  42.86 
 
 
137 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  43.56 
 
 
117 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  39.6 
 
 
122 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  33.64 
 
 
141 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  35.79 
 
 
137 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  40.66 
 
 
164 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  37.93 
 
 
156 aa  85.9  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.36 
 
 
128 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  35.92 
 
 
115 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  35.58 
 
 
109 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  39.56 
 
 
123 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  38.3 
 
 
159 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  38.24 
 
 
105 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  37.74 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  37.25 
 
 
105 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  36.27 
 
 
123 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  39.78 
 
 
117 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  35.51 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  37.25 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  37.25 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  37 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  40.86 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  36.54 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  36.21 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  32.04 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  32.38 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  35.35 
 
 
112 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  34.58 
 
 
120 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  34.65 
 
 
105 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  40.4 
 
 
105 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  33.33 
 
 
112 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  37 
 
 
108 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>