40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1647 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  51.74 
 
 		 939 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  41.27 
 
 		 980 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  42.97 
 
 		 953 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  42.8 
 
 		 948 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  41.8 
 
 		 941 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  38.37 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  41.53 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  40.73 
 
 		 961 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1002 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  40.56 
 
 		 918 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  38.15 
 
 		 917 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  39.2 
 
 		 943 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  40 
 
 		 942 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  38.49 
 
 		 948 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  38.55 
 
 		 933 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  38.65 
 
 		 922 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  34.78 
 
 		 908 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  30.47 
 
 		 917 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  31.08 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  27.76 
 
 		 985 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  27.27 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  27.76 
 
 		 925 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  27.76 
 
 		 919 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  30.8 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  24.4 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  27.88 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  29.68 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  23.9 
 
 		 970 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  23.9 
 
 		 923 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  24.79 
 
 		 391 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  24.88 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  24.32 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  25.6 
 
 		 948 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  21.66 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  22.28 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  22.28 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  22.34 
 
 		 392 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  24.31 
 
 		 448 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  27.05 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>